Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 TRIT1-212ENST00000492612 983 ntTSL 512.23□□□□□ -0.451e-8■■■□□ 16.1
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ILF3Q12906 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.461e-8■■■□□ 16.1
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ILF3Q12906 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.217e-7■■■□□ 16
ILF3Q12906 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.147e-7■■■□□ 16
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ILF3Q12906 ARHGEF1-210ENST00000594521 826 ntTSL 517.2■□□□□ 0.343e-7■■■□□ 16
ILF3Q12906 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.073e-7■■■□□ 16
ILF3Q12906 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.073e-7■■■□□ 16
ILF3Q12906 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.273e-7■■■□□ 16
ILF3Q12906 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.283e-7■■■□□ 16
ILF3Q12906 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.53e-7■■■□□ 16
ILF3Q12906 ARHGEF1-220ENST00000600274 3439 ntTSL 1 (best)10.83□□□□□ -0.683e-7■■■□□ 16
ILF3Q12906 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.011e-6■■■□□ 16
ILF3Q12906 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.011e-6■■■□□ 16
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ILF3Q12906 NPIPB4-209ENST00000538859 526 ntTSL 51.48□□□□□ -2.171e-7■■■□□ 16
ILF3Q12906 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.349e-7■■■□□ 16
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ILF3Q12906 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.199e-7■■■□□ 16
ILF3Q12906 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.189e-7■■■□□ 16
ILF3Q12906 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.049e-7■■■□□ 16
ILF3Q12906 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.069e-7■■■□□ 16
ILF3Q12906 DNM1-204ENST00000441149 3286 ntTSL 1 (best)14.23□□□□□ -0.139e-7■■■□□ 16
ILF3Q12906 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.199e-7■■■□□ 16
ILF3Q12906 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.329e-7■■■□□ 16
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