Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP62P37198 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP62P37198 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP62P37198 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP62P37198 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP62P37198 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP62P37198 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP62P37198 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP62P37198 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP62P37198 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP62P37198 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP62P37198 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP62P37198 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP62P37198 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP62P37198 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP62P37198 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP62P37198 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP62P37198 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP62P37198 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP62P37198 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP62P37198 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP62P37198 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP62P37198 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP62P37198 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP62P37198 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP62P37198 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP62P37198 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP62P37198 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP62P37198 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP62P37198 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP62P37198 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP62P37198 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP62P37198 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP62P37198 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP62P37198 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP62P37198 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP62P37198 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP62P37198 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP62P37198 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP62P37198 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP62P37198 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP62P37198 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP62P37198 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP62P37198 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP62P37198 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP62P37198 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP62P37198 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP62P37198 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP62P37198 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP62P37198 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP62P37198 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP62P37198 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP62P37198 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP62P37198 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP62P37198 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP62P37198 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP62P37198 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP62P37198 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP62P37198 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP62P37198 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP62P37198 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP62P37198 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NUP62P37198 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
NUP62P37198 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NUP62P37198 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NUP62P37198 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP62P37198 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP62P37198 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP62P37198 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP62P37198 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP62P37198 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP62P37198 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP62P37198 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP62P37198 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP62P37198 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP62P37198 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP62P37198 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP62P37198 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP62P37198 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP62P37198 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP62P37198 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP62P37198 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP62P37198 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP62P37198 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP62P37198 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP62P37198 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP62P37198 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP62P37198 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP62P37198 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP62P37198 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP62P37198 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP62P37198 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms