Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A3GALT2U3KPV4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A3GALT2U3KPV4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A3GALT2U3KPV4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A3GALT2U3KPV4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A3GALT2U3KPV4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A3GALT2U3KPV4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A3GALT2U3KPV4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A3GALT2U3KPV4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A3GALT2U3KPV4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A3GALT2U3KPV4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A3GALT2U3KPV4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A3GALT2U3KPV4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A3GALT2U3KPV4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A3GALT2U3KPV4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A3GALT2U3KPV4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A3GALT2U3KPV4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A3GALT2U3KPV4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A3GALT2U3KPV4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A3GALT2U3KPV4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
A3GALT2U3KPV4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A3GALT2U3KPV4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A3GALT2U3KPV4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
A3GALT2U3KPV4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
A3GALT2U3KPV4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A3GALT2U3KPV4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A3GALT2U3KPV4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A3GALT2U3KPV4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A3GALT2U3KPV4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A3GALT2U3KPV4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A3GALT2U3KPV4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A3GALT2U3KPV4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A3GALT2U3KPV4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A3GALT2U3KPV4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A3GALT2U3KPV4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A3GALT2U3KPV4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A3GALT2U3KPV4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
A3GALT2U3KPV4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A3GALT2U3KPV4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A3GALT2U3KPV4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A3GALT2U3KPV4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A3GALT2U3KPV4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A3GALT2U3KPV4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A3GALT2U3KPV4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A3GALT2U3KPV4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A3GALT2U3KPV4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A3GALT2U3KPV4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A3GALT2U3KPV4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A3GALT2U3KPV4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A3GALT2U3KPV4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A3GALT2U3KPV4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A3GALT2U3KPV4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A3GALT2U3KPV4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A3GALT2U3KPV4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A3GALT2U3KPV4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A3GALT2U3KPV4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A3GALT2U3KPV4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A3GALT2U3KPV4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A3GALT2U3KPV4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A3GALT2U3KPV4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A3GALT2U3KPV4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
A3GALT2U3KPV4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A3GALT2U3KPV4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A3GALT2U3KPV4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A3GALT2U3KPV4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A3GALT2U3KPV4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A3GALT2U3KPV4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A3GALT2U3KPV4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A3GALT2U3KPV4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A3GALT2U3KPV4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A3GALT2U3KPV4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A3GALT2U3KPV4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A3GALT2U3KPV4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A3GALT2U3KPV4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A3GALT2U3KPV4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A3GALT2U3KPV4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A3GALT2U3KPV4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A3GALT2U3KPV4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A3GALT2U3KPV4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
A3GALT2U3KPV4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A3GALT2U3KPV4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A3GALT2U3KPV4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A3GALT2U3KPV4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A3GALT2U3KPV4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A3GALT2U3KPV4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A3GALT2U3KPV4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A3GALT2U3KPV4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A3GALT2U3KPV4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A3GALT2U3KPV4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A3GALT2U3KPV4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A3GALT2U3KPV4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A3GALT2U3KPV4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A3GALT2U3KPV4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A3GALT2U3KPV4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A3GALT2U3KPV4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A3GALT2U3KPV4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A3GALT2U3KPV4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A3GALT2U3KPV4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A3GALT2U3KPV4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A3GALT2U3KPV4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms