Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y262

EIF3L, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3LQ9Y262 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3LQ9Y262 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3LQ9Y262 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3LQ9Y262 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EIF3LQ9Y262 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EIF3LQ9Y262 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF3LQ9Y262 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF3LQ9Y262 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3LQ9Y262 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3LQ9Y262 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3LQ9Y262 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3LQ9Y262 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3LQ9Y262 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3LQ9Y262 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3LQ9Y262 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3LQ9Y262 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3LQ9Y262 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3LQ9Y262 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3LQ9Y262 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3LQ9Y262 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3LQ9Y262 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3LQ9Y262 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3LQ9Y262 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3LQ9Y262 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3LQ9Y262 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3LQ9Y262 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3LQ9Y262 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3LQ9Y262 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3LQ9Y262 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3LQ9Y262 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3LQ9Y262 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3LQ9Y262 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3LQ9Y262 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3LQ9Y262 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3LQ9Y262 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3LQ9Y262 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF3LQ9Y262 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF3LQ9Y262 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF3LQ9Y262 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3LQ9Y262 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3LQ9Y262 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3LQ9Y262 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3LQ9Y262 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3LQ9Y262 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3LQ9Y262 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3LQ9Y262 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3LQ9Y262 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3LQ9Y262 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF3LQ9Y262 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF3LQ9Y262 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF3LQ9Y262 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF3LQ9Y262 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF3LQ9Y262 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF3LQ9Y262 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF3LQ9Y262 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF3LQ9Y262 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF3LQ9Y262 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF3LQ9Y262 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF3LQ9Y262 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF3LQ9Y262 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF3LQ9Y262 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3LQ9Y262 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3LQ9Y262 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3LQ9Y262 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF3LQ9Y262 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF3LQ9Y262 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF3LQ9Y262 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3LQ9Y262 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3LQ9Y262 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3LQ9Y262 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3LQ9Y262 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3LQ9Y262 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3LQ9Y262 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3LQ9Y262 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3LQ9Y262 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3LQ9Y262 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3LQ9Y262 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3LQ9Y262 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3LQ9Y262 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3LQ9Y262 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3LQ9Y262 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3LQ9Y262 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3LQ9Y262 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3LQ9Y262 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3LQ9Y262 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3LQ9Y262 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EIF3LQ9Y262 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3LQ9Y262 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3LQ9Y262 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3LQ9Y262 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3LQ9Y262 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3LQ9Y262 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3LQ9Y262 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3LQ9Y262 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3LQ9Y262 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3LQ9Y262 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3LQ9Y262 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3LQ9Y262 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3LQ9Y262 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3LQ9Y262 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms