Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC8A2Q9UPR5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC8A2Q9UPR5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC8A2Q9UPR5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC8A2Q9UPR5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC8A2Q9UPR5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC8A2Q9UPR5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC8A2Q9UPR5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC8A2Q9UPR5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC8A2Q9UPR5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC8A2Q9UPR5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC8A2Q9UPR5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC8A2Q9UPR5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC8A2Q9UPR5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC8A2Q9UPR5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC8A2Q9UPR5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC8A2Q9UPR5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC8A2Q9UPR5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC8A2Q9UPR5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC8A2Q9UPR5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC8A2Q9UPR5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC8A2Q9UPR5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC8A2Q9UPR5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC8A2Q9UPR5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC8A2Q9UPR5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC8A2Q9UPR5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC8A2Q9UPR5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC8A2Q9UPR5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC8A2Q9UPR5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC8A2Q9UPR5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC8A2Q9UPR5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC8A2Q9UPR5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC8A2Q9UPR5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC8A2Q9UPR5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC8A2Q9UPR5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC8A2Q9UPR5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC8A2Q9UPR5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC8A2Q9UPR5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC8A2Q9UPR5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC8A2Q9UPR5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC8A2Q9UPR5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC8A2Q9UPR5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC8A2Q9UPR5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC8A2Q9UPR5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC8A2Q9UPR5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC8A2Q9UPR5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC8A2Q9UPR5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC8A2Q9UPR5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC8A2Q9UPR5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC8A2Q9UPR5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC8A2Q9UPR5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC8A2Q9UPR5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC8A2Q9UPR5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC8A2Q9UPR5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC8A2Q9UPR5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC8A2Q9UPR5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC8A2Q9UPR5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC8A2Q9UPR5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC8A2Q9UPR5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC8A2Q9UPR5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC8A2Q9UPR5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC8A2Q9UPR5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC8A2Q9UPR5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC8A2Q9UPR5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC8A2Q9UPR5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC8A2Q9UPR5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC8A2Q9UPR5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC8A2Q9UPR5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC8A2Q9UPR5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC8A2Q9UPR5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC8A2Q9UPR5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC8A2Q9UPR5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC8A2Q9UPR5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC8A2Q9UPR5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC8A2Q9UPR5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC8A2Q9UPR5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC8A2Q9UPR5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC8A2Q9UPR5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC8A2Q9UPR5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC8A2Q9UPR5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC8A2Q9UPR5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC8A2Q9UPR5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC8A2Q9UPR5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC8A2Q9UPR5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC8A2Q9UPR5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC8A2Q9UPR5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC8A2Q9UPR5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC8A2Q9UPR5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC8A2Q9UPR5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC8A2Q9UPR5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC8A2Q9UPR5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC8A2Q9UPR5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC8A2Q9UPR5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC8A2Q9UPR5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC8A2Q9UPR5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC8A2Q9UPR5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC8A2Q9UPR5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC8A2Q9UPR5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC8A2Q9UPR5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC8A2Q9UPR5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms