Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM00

TMCO1, Calcium load-activated calcium channel, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO1Q9UM00 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMCO1Q9UM00 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMCO1Q9UM00 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMCO1Q9UM00 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMCO1Q9UM00 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMCO1Q9UM00 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMCO1Q9UM00 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMCO1Q9UM00 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMCO1Q9UM00 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMCO1Q9UM00 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMCO1Q9UM00 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMCO1Q9UM00 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMCO1Q9UM00 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMCO1Q9UM00 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMCO1Q9UM00 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TMCO1Q9UM00 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TMCO1Q9UM00 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TMCO1Q9UM00 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMCO1Q9UM00 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMCO1Q9UM00 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMCO1Q9UM00 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMCO1Q9UM00 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMCO1Q9UM00 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMCO1Q9UM00 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMCO1Q9UM00 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMCO1Q9UM00 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMCO1Q9UM00 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMCO1Q9UM00 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMCO1Q9UM00 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TMCO1Q9UM00 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMCO1Q9UM00 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMCO1Q9UM00 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMCO1Q9UM00 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMCO1Q9UM00 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMCO1Q9UM00 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMCO1Q9UM00 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMCO1Q9UM00 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMCO1Q9UM00 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMCO1Q9UM00 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TMCO1Q9UM00 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMCO1Q9UM00 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMCO1Q9UM00 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMCO1Q9UM00 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMCO1Q9UM00 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMCO1Q9UM00 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMCO1Q9UM00 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMCO1Q9UM00 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMCO1Q9UM00 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMCO1Q9UM00 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMCO1Q9UM00 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMCO1Q9UM00 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMCO1Q9UM00 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMCO1Q9UM00 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMCO1Q9UM00 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMCO1Q9UM00 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMCO1Q9UM00 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMCO1Q9UM00 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMCO1Q9UM00 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMCO1Q9UM00 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCO1Q9UM00 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCO1Q9UM00 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCO1Q9UM00 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO1Q9UM00 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO1Q9UM00 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO1Q9UM00 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO1Q9UM00 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO1Q9UM00 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO1Q9UM00 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO1Q9UM00 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO1Q9UM00 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO1Q9UM00 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO1Q9UM00 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO1Q9UM00 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO1Q9UM00 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO1Q9UM00 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO1Q9UM00 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO1Q9UM00 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO1Q9UM00 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO1Q9UM00 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO1Q9UM00 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO1Q9UM00 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO1Q9UM00 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO1Q9UM00 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO1Q9UM00 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO1Q9UM00 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCO1Q9UM00 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCO1Q9UM00 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCO1Q9UM00 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCO1Q9UM00 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCO1Q9UM00 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO1Q9UM00 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO1Q9UM00 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO1Q9UM00 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO1Q9UM00 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO1Q9UM00 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO1Q9UM00 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO1Q9UM00 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO1Q9UM00 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO1Q9UM00 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO1Q9UM00 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
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