Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK05

GDF2, Growth/differentiation factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF2Q9UK05 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF2Q9UK05 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF2Q9UK05 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF2Q9UK05 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF2Q9UK05 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF2Q9UK05 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF2Q9UK05 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF2Q9UK05 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF2Q9UK05 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF2Q9UK05 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF2Q9UK05 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF2Q9UK05 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF2Q9UK05 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF2Q9UK05 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF2Q9UK05 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF2Q9UK05 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF2Q9UK05 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF2Q9UK05 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF2Q9UK05 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF2Q9UK05 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF2Q9UK05 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF2Q9UK05 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF2Q9UK05 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF2Q9UK05 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF2Q9UK05 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF2Q9UK05 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF2Q9UK05 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF2Q9UK05 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF2Q9UK05 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF2Q9UK05 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF2Q9UK05 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF2Q9UK05 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF2Q9UK05 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF2Q9UK05 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF2Q9UK05 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF2Q9UK05 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF2Q9UK05 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF2Q9UK05 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF2Q9UK05 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF2Q9UK05 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF2Q9UK05 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF2Q9UK05 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF2Q9UK05 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF2Q9UK05 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF2Q9UK05 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF2Q9UK05 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF2Q9UK05 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF2Q9UK05 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF2Q9UK05 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF2Q9UK05 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF2Q9UK05 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF2Q9UK05 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF2Q9UK05 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF2Q9UK05 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF2Q9UK05 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GDF2Q9UK05 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF2Q9UK05 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF2Q9UK05 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF2Q9UK05 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF2Q9UK05 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF2Q9UK05 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF2Q9UK05 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF2Q9UK05 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF2Q9UK05 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF2Q9UK05 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF2Q9UK05 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF2Q9UK05 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF2Q9UK05 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF2Q9UK05 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF2Q9UK05 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF2Q9UK05 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF2Q9UK05 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF2Q9UK05 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF2Q9UK05 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF2Q9UK05 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF2Q9UK05 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF2Q9UK05 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF2Q9UK05 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF2Q9UK05 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF2Q9UK05 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF2Q9UK05 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF2Q9UK05 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF2Q9UK05 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF2Q9UK05 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF2Q9UK05 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF2Q9UK05 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF2Q9UK05 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF2Q9UK05 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF2Q9UK05 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF2Q9UK05 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF2Q9UK05 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF2Q9UK05 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF2Q9UK05 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF2Q9UK05 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF2Q9UK05 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF2Q9UK05 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF2Q9UK05 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF2Q9UK05 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF2Q9UK05 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF2Q9UK05 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms