Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3BP4Q9P0V3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3BP4Q9P0V3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3BP4Q9P0V3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3BP4Q9P0V3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3BP4Q9P0V3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3BP4Q9P0V3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3BP4Q9P0V3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3BP4Q9P0V3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3BP4Q9P0V3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3BP4Q9P0V3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3BP4Q9P0V3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3BP4Q9P0V3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3BP4Q9P0V3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3BP4Q9P0V3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3BP4Q9P0V3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3BP4Q9P0V3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3BP4Q9P0V3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3BP4Q9P0V3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3BP4Q9P0V3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3BP4Q9P0V3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3BP4Q9P0V3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3BP4Q9P0V3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3BP4Q9P0V3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3BP4Q9P0V3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SH3BP4Q9P0V3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3BP4Q9P0V3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3BP4Q9P0V3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3BP4Q9P0V3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3BP4Q9P0V3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3BP4Q9P0V3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3BP4Q9P0V3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3BP4Q9P0V3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3BP4Q9P0V3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3BP4Q9P0V3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3BP4Q9P0V3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3BP4Q9P0V3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3BP4Q9P0V3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3BP4Q9P0V3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3BP4Q9P0V3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3BP4Q9P0V3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3BP4Q9P0V3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3BP4Q9P0V3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3BP4Q9P0V3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3BP4Q9P0V3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3BP4Q9P0V3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3BP4Q9P0V3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3BP4Q9P0V3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3BP4Q9P0V3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3BP4Q9P0V3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3BP4Q9P0V3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SH3BP4Q9P0V3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3BP4Q9P0V3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3BP4Q9P0V3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3BP4Q9P0V3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3BP4Q9P0V3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3BP4Q9P0V3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP4Q9P0V3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP4Q9P0V3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP4Q9P0V3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP4Q9P0V3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP4Q9P0V3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP4Q9P0V3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP4Q9P0V3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP4Q9P0V3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP4Q9P0V3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP4Q9P0V3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP4Q9P0V3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP4Q9P0V3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3BP4Q9P0V3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3BP4Q9P0V3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3BP4Q9P0V3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3BP4Q9P0V3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3BP4Q9P0V3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3BP4Q9P0V3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3BP4Q9P0V3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3BP4Q9P0V3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3BP4Q9P0V3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3BP4Q9P0V3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3BP4Q9P0V3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3BP4Q9P0V3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3BP4Q9P0V3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3BP4Q9P0V3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3BP4Q9P0V3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3BP4Q9P0V3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3BP4Q9P0V3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3BP4Q9P0V3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3BP4Q9P0V3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3BP4Q9P0V3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3BP4Q9P0V3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3BP4Q9P0V3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms