Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR4

VSX1, Visual system homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1Q9NZR4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VSX1Q9NZR4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VSX1Q9NZR4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSX1Q9NZR4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VSX1Q9NZR4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VSX1Q9NZR4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSX1Q9NZR4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSX1Q9NZR4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSX1Q9NZR4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSX1Q9NZR4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSX1Q9NZR4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSX1Q9NZR4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSX1Q9NZR4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSX1Q9NZR4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSX1Q9NZR4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSX1Q9NZR4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSX1Q9NZR4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSX1Q9NZR4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSX1Q9NZR4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSX1Q9NZR4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSX1Q9NZR4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSX1Q9NZR4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VSX1Q9NZR4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSX1Q9NZR4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VSX1Q9NZR4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSX1Q9NZR4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSX1Q9NZR4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSX1Q9NZR4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSX1Q9NZR4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSX1Q9NZR4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSX1Q9NZR4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSX1Q9NZR4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSX1Q9NZR4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSX1Q9NZR4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSX1Q9NZR4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSX1Q9NZR4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSX1Q9NZR4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSX1Q9NZR4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VSX1Q9NZR4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSX1Q9NZR4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSX1Q9NZR4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSX1Q9NZR4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSX1Q9NZR4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSX1Q9NZR4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSX1Q9NZR4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSX1Q9NZR4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSX1Q9NZR4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSX1Q9NZR4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSX1Q9NZR4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSX1Q9NZR4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSX1Q9NZR4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSX1Q9NZR4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSX1Q9NZR4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSX1Q9NZR4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSX1Q9NZR4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSX1Q9NZR4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
VSX1Q9NZR4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSX1Q9NZR4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSX1Q9NZR4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSX1Q9NZR4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSX1Q9NZR4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSX1Q9NZR4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSX1Q9NZR4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSX1Q9NZR4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSX1Q9NZR4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSX1Q9NZR4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSX1Q9NZR4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSX1Q9NZR4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSX1Q9NZR4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSX1Q9NZR4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSX1Q9NZR4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSX1Q9NZR4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSX1Q9NZR4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSX1Q9NZR4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSX1Q9NZR4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSX1Q9NZR4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSX1Q9NZR4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSX1Q9NZR4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSX1Q9NZR4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSX1Q9NZR4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSX1Q9NZR4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSX1Q9NZR4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSX1Q9NZR4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSX1Q9NZR4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VSX1Q9NZR4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSX1Q9NZR4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSX1Q9NZR4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSX1Q9NZR4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSX1Q9NZR4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSX1Q9NZR4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSX1Q9NZR4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSX1Q9NZR4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSX1Q9NZR4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSX1Q9NZR4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSX1Q9NZR4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSX1Q9NZR4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSX1Q9NZR4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSX1Q9NZR4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSX1Q9NZR4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSX1Q9NZR4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.7 ms