Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATAD3AQ9NVI7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATAD3AQ9NVI7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATAD3AQ9NVI7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ATAD3AQ9NVI7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATAD3AQ9NVI7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATAD3AQ9NVI7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATAD3AQ9NVI7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATAD3AQ9NVI7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATAD3AQ9NVI7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATAD3AQ9NVI7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATAD3AQ9NVI7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATAD3AQ9NVI7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATAD3AQ9NVI7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATAD3AQ9NVI7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATAD3AQ9NVI7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATAD3AQ9NVI7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATAD3AQ9NVI7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATAD3AQ9NVI7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATAD3AQ9NVI7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATAD3AQ9NVI7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATAD3AQ9NVI7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATAD3AQ9NVI7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATAD3AQ9NVI7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATAD3AQ9NVI7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATAD3AQ9NVI7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATAD3AQ9NVI7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATAD3AQ9NVI7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATAD3AQ9NVI7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATAD3AQ9NVI7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATAD3AQ9NVI7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATAD3AQ9NVI7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATAD3AQ9NVI7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATAD3AQ9NVI7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATAD3AQ9NVI7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATAD3AQ9NVI7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATAD3AQ9NVI7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATAD3AQ9NVI7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATAD3AQ9NVI7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATAD3AQ9NVI7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATAD3AQ9NVI7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATAD3AQ9NVI7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATAD3AQ9NVI7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATAD3AQ9NVI7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATAD3AQ9NVI7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATAD3AQ9NVI7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATAD3AQ9NVI7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATAD3AQ9NVI7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATAD3AQ9NVI7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATAD3AQ9NVI7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATAD3AQ9NVI7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATAD3AQ9NVI7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATAD3AQ9NVI7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATAD3AQ9NVI7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATAD3AQ9NVI7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATAD3AQ9NVI7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATAD3AQ9NVI7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATAD3AQ9NVI7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATAD3AQ9NVI7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATAD3AQ9NVI7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATAD3AQ9NVI7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATAD3AQ9NVI7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATAD3AQ9NVI7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATAD3AQ9NVI7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATAD3AQ9NVI7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATAD3AQ9NVI7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATAD3AQ9NVI7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATAD3AQ9NVI7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATAD3AQ9NVI7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATAD3AQ9NVI7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATAD3AQ9NVI7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATAD3AQ9NVI7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATAD3AQ9NVI7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATAD3AQ9NVI7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATAD3AQ9NVI7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATAD3AQ9NVI7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATAD3AQ9NVI7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATAD3AQ9NVI7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATAD3AQ9NVI7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATAD3AQ9NVI7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATAD3AQ9NVI7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATAD3AQ9NVI7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATAD3AQ9NVI7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATAD3AQ9NVI7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATAD3AQ9NVI7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATAD3AQ9NVI7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATAD3AQ9NVI7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATAD3AQ9NVI7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATAD3AQ9NVI7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATAD3AQ9NVI7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATAD3AQ9NVI7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATAD3AQ9NVI7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATAD3AQ9NVI7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATAD3AQ9NVI7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATAD3AQ9NVI7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATAD3AQ9NVI7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATAD3AQ9NVI7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATAD3AQ9NVI7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms