Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP99

TREM1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM1Q9NP99 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TREM1Q9NP99 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TREM1Q9NP99 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TREM1Q9NP99 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TREM1Q9NP99 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TREM1Q9NP99 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TREM1Q9NP99 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TREM1Q9NP99 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TREM1Q9NP99 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TREM1Q9NP99 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TREM1Q9NP99 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TREM1Q9NP99 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TREM1Q9NP99 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TREM1Q9NP99 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TREM1Q9NP99 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TREM1Q9NP99 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TREM1Q9NP99 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREM1Q9NP99 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREM1Q9NP99 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREM1Q9NP99 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREM1Q9NP99 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREM1Q9NP99 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREM1Q9NP99 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREM1Q9NP99 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREM1Q9NP99 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREM1Q9NP99 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREM1Q9NP99 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREM1Q9NP99 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREM1Q9NP99 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREM1Q9NP99 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREM1Q9NP99 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREM1Q9NP99 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREM1Q9NP99 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREM1Q9NP99 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREM1Q9NP99 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREM1Q9NP99 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREM1Q9NP99 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREM1Q9NP99 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREM1Q9NP99 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREM1Q9NP99 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREM1Q9NP99 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREM1Q9NP99 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TREM1Q9NP99 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TREM1Q9NP99 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TREM1Q9NP99 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TREM1Q9NP99 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TREM1Q9NP99 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TREM1Q9NP99 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TREM1Q9NP99 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TREM1Q9NP99 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TREM1Q9NP99 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TREM1Q9NP99 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TREM1Q9NP99 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TREM1Q9NP99 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TREM1Q9NP99 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TREM1Q9NP99 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TREM1Q9NP99 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TREM1Q9NP99 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TREM1Q9NP99 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TREM1Q9NP99 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TREM1Q9NP99 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TREM1Q9NP99 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TREM1Q9NP99 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TREM1Q9NP99 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TREM1Q9NP99 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TREM1Q9NP99 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TREM1Q9NP99 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TREM1Q9NP99 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TREM1Q9NP99 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TREM1Q9NP99 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TREM1Q9NP99 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TREM1Q9NP99 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TREM1Q9NP99 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TREM1Q9NP99 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TREM1Q9NP99 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TREM1Q9NP99 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TREM1Q9NP99 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TREM1Q9NP99 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TREM1Q9NP99 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TREM1Q9NP99 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TREM1Q9NP99 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TREM1Q9NP99 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TREM1Q9NP99 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TREM1Q9NP99 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TREM1Q9NP99 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TREM1Q9NP99 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TREM1Q9NP99 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TREM1Q9NP99 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TREM1Q9NP99 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TREM1Q9NP99 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TREM1Q9NP99 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TREM1Q9NP99 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TREM1Q9NP99 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TREM1Q9NP99 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TREM1Q9NP99 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TREM1Q9NP99 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TREM1Q9NP99 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TREM1Q9NP99 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TREM1Q9NP99 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TREM1Q9NP99 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms