Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMG20AQ9NP66 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMG20AQ9NP66 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMG20AQ9NP66 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMG20AQ9NP66 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMG20AQ9NP66 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMG20AQ9NP66 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMG20AQ9NP66 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMG20AQ9NP66 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMG20AQ9NP66 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMG20AQ9NP66 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMG20AQ9NP66 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMG20AQ9NP66 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMG20AQ9NP66 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMG20AQ9NP66 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HMG20AQ9NP66 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMG20AQ9NP66 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMG20AQ9NP66 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMG20AQ9NP66 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMG20AQ9NP66 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMG20AQ9NP66 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMG20AQ9NP66 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMG20AQ9NP66 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMG20AQ9NP66 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMG20AQ9NP66 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMG20AQ9NP66 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMG20AQ9NP66 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMG20AQ9NP66 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMG20AQ9NP66 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMG20AQ9NP66 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMG20AQ9NP66 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMG20AQ9NP66 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMG20AQ9NP66 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMG20AQ9NP66 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMG20AQ9NP66 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMG20AQ9NP66 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMG20AQ9NP66 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMG20AQ9NP66 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMG20AQ9NP66 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMG20AQ9NP66 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMG20AQ9NP66 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMG20AQ9NP66 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMG20AQ9NP66 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMG20AQ9NP66 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMG20AQ9NP66 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMG20AQ9NP66 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMG20AQ9NP66 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMG20AQ9NP66 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMG20AQ9NP66 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMG20AQ9NP66 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMG20AQ9NP66 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMG20AQ9NP66 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMG20AQ9NP66 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMG20AQ9NP66 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMG20AQ9NP66 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMG20AQ9NP66 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMG20AQ9NP66 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMG20AQ9NP66 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMG20AQ9NP66 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMG20AQ9NP66 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HMG20AQ9NP66 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMG20AQ9NP66 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMG20AQ9NP66 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HMG20AQ9NP66 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMG20AQ9NP66 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMG20AQ9NP66 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HMG20AQ9NP66 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HMG20AQ9NP66 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HMG20AQ9NP66 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMG20AQ9NP66 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMG20AQ9NP66 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMG20AQ9NP66 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HMG20AQ9NP66 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMG20AQ9NP66 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMG20AQ9NP66 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMG20AQ9NP66 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMG20AQ9NP66 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMG20AQ9NP66 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMG20AQ9NP66 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20AQ9NP66 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20AQ9NP66 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20AQ9NP66 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20AQ9NP66 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20AQ9NP66 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20AQ9NP66 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMG20AQ9NP66 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMG20AQ9NP66 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMG20AQ9NP66 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMG20AQ9NP66 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMG20AQ9NP66 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMG20AQ9NP66 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMG20AQ9NP66 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMG20AQ9NP66 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMG20AQ9NP66 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMG20AQ9NP66 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMG20AQ9NP66 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMG20AQ9NP66 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMG20AQ9NP66 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HMG20AQ9NP66 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HMG20AQ9NP66 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms