Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ELL3Q9HB65 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ELL3Q9HB65 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ELL3Q9HB65 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ELL3Q9HB65 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ELL3Q9HB65 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ELL3Q9HB65 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ELL3Q9HB65 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ELL3Q9HB65 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ELL3Q9HB65 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ELL3Q9HB65 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ELL3Q9HB65 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ELL3Q9HB65 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ELL3Q9HB65 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ELL3Q9HB65 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ELL3Q9HB65 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ELL3Q9HB65 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ELL3Q9HB65 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ELL3Q9HB65 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ELL3Q9HB65 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ELL3Q9HB65 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ELL3Q9HB65 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ELL3Q9HB65 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ELL3Q9HB65 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ELL3Q9HB65 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ELL3Q9HB65 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ELL3Q9HB65 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ELL3Q9HB65 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ELL3Q9HB65 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ELL3Q9HB65 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ELL3Q9HB65 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ELL3Q9HB65 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ELL3Q9HB65 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ELL3Q9HB65 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ELL3Q9HB65 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ELL3Q9HB65 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ELL3Q9HB65 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ELL3Q9HB65 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ELL3Q9HB65 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ELL3Q9HB65 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ELL3Q9HB65 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ELL3Q9HB65 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ELL3Q9HB65 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ELL3Q9HB65 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ELL3Q9HB65 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ELL3Q9HB65 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ELL3Q9HB65 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ELL3Q9HB65 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ELL3Q9HB65 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELL3Q9HB65 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELL3Q9HB65 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELL3Q9HB65 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELL3Q9HB65 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELL3Q9HB65 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELL3Q9HB65 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELL3Q9HB65 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELL3Q9HB65 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELL3Q9HB65 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELL3Q9HB65 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELL3Q9HB65 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELL3Q9HB65 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELL3Q9HB65 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELL3Q9HB65 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELL3Q9HB65 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELL3Q9HB65 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELL3Q9HB65 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELL3Q9HB65 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELL3Q9HB65 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELL3Q9HB65 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELL3Q9HB65 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ELL3Q9HB65 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELL3Q9HB65 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELL3Q9HB65 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELL3Q9HB65 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELL3Q9HB65 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ELL3Q9HB65 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ELL3Q9HB65 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ELL3Q9HB65 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ELL3Q9HB65 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ELL3Q9HB65 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ELL3Q9HB65 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELL3Q9HB65 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELL3Q9HB65 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELL3Q9HB65 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELL3Q9HB65 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELL3Q9HB65 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELL3Q9HB65 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELL3Q9HB65 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELL3Q9HB65 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELL3Q9HB65 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ELL3Q9HB65 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ELL3Q9HB65 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ELL3Q9HB65 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ELL3Q9HB65 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ELL3Q9HB65 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ELL3Q9HB65 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELL3Q9HB65 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELL3Q9HB65 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELL3Q9HB65 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ELL3Q9HB65 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms