Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHOJQ9H4E5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOJQ9H4E5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOJQ9H4E5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOJQ9H4E5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOJQ9H4E5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOJQ9H4E5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOJQ9H4E5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOJQ9H4E5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOJQ9H4E5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOJQ9H4E5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOJQ9H4E5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOJQ9H4E5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOJQ9H4E5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOJQ9H4E5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOJQ9H4E5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOJQ9H4E5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOJQ9H4E5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOJQ9H4E5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOJQ9H4E5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOJQ9H4E5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOJQ9H4E5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOJQ9H4E5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHOJQ9H4E5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHOJQ9H4E5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RHOJQ9H4E5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOJQ9H4E5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOJQ9H4E5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOJQ9H4E5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOJQ9H4E5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOJQ9H4E5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHOJQ9H4E5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHOJQ9H4E5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHOJQ9H4E5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RHOJQ9H4E5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHOJQ9H4E5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHOJQ9H4E5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHOJQ9H4E5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHOJQ9H4E5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOJQ9H4E5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOJQ9H4E5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHOJQ9H4E5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHOJQ9H4E5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOJQ9H4E5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOJQ9H4E5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOJQ9H4E5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOJQ9H4E5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RHOJQ9H4E5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHOJQ9H4E5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHOJQ9H4E5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHOJQ9H4E5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHOJQ9H4E5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHOJQ9H4E5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHOJQ9H4E5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHOJQ9H4E5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHOJQ9H4E5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHOJQ9H4E5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHOJQ9H4E5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHOJQ9H4E5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHOJQ9H4E5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHOJQ9H4E5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHOJQ9H4E5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHOJQ9H4E5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHOJQ9H4E5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHOJQ9H4E5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHOJQ9H4E5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHOJQ9H4E5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHOJQ9H4E5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RHOJQ9H4E5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RHOJQ9H4E5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHOJQ9H4E5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHOJQ9H4E5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHOJQ9H4E5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RHOJQ9H4E5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHOJQ9H4E5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHOJQ9H4E5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHOJQ9H4E5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOJQ9H4E5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOJQ9H4E5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOJQ9H4E5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOJQ9H4E5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOJQ9H4E5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOJQ9H4E5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHOJQ9H4E5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHOJQ9H4E5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHOJQ9H4E5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOJQ9H4E5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOJQ9H4E5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOJQ9H4E5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOJQ9H4E5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOJQ9H4E5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHOJQ9H4E5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHOJQ9H4E5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHOJQ9H4E5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHOJQ9H4E5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RHOJQ9H4E5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHOJQ9H4E5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHOJQ9H4E5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHOJQ9H4E5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHOJQ9H4E5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms