Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RHOJQ9H4E5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
RHOJQ9H4E5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
RHOJQ9H4E5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
RHOJQ9H4E5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
RHOJQ9H4E5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RHOJQ9H4E5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RHOJQ9H4E5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RHOJQ9H4E5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RHOJQ9H4E5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RHOJQ9H4E5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RHOJQ9H4E5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RHOJQ9H4E5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RHOJQ9H4E5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RHOJQ9H4E5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
RHOJQ9H4E5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
RHOJQ9H4E5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RHOJQ9H4E5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
RHOJQ9H4E5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
RHOJQ9H4E5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
RHOJQ9H4E5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
RHOJQ9H4E5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
RHOJQ9H4E5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RHOJQ9H4E5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RHOJQ9H4E5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RHOJQ9H4E5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RHOJQ9H4E5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RHOJQ9H4E5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RHOJQ9H4E5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RHOJQ9H4E5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RHOJQ9H4E5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RHOJQ9H4E5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RHOJQ9H4E5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RHOJQ9H4E5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RHOJQ9H4E5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RHOJQ9H4E5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RHOJQ9H4E5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RHOJQ9H4E5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RHOJQ9H4E5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RHOJQ9H4E5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RHOJQ9H4E5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RHOJQ9H4E5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RHOJQ9H4E5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RHOJQ9H4E5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RHOJQ9H4E5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RHOJQ9H4E5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RHOJQ9H4E5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RHOJQ9H4E5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RHOJQ9H4E5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RHOJQ9H4E5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RHOJQ9H4E5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RHOJQ9H4E5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
RHOJQ9H4E5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RHOJQ9H4E5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
RHOJQ9H4E5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RHOJQ9H4E5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RHOJQ9H4E5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RHOJQ9H4E5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RHOJQ9H4E5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RHOJQ9H4E5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RHOJQ9H4E5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RHOJQ9H4E5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RHOJQ9H4E5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RHOJQ9H4E5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RHOJQ9H4E5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RHOJQ9H4E5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RHOJQ9H4E5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RHOJQ9H4E5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RHOJQ9H4E5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RHOJQ9H4E5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RHOJQ9H4E5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RHOJQ9H4E5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RHOJQ9H4E5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RHOJQ9H4E5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RHOJQ9H4E5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RHOJQ9H4E5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RHOJQ9H4E5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RHOJQ9H4E5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RHOJQ9H4E5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RHOJQ9H4E5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RHOJQ9H4E5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RHOJQ9H4E5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RHOJQ9H4E5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RHOJQ9H4E5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RHOJQ9H4E5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RHOJQ9H4E5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RHOJQ9H4E5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RHOJQ9H4E5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RHOJQ9H4E5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RHOJQ9H4E5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RHOJQ9H4E5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RHOJQ9H4E5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RHOJQ9H4E5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RHOJQ9H4E5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RHOJQ9H4E5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RHOJQ9H4E5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RHOJQ9H4E5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RHOJQ9H4E5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RHOJQ9H4E5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RHOJQ9H4E5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 293.1 ms