Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T2

SEMA6C, Semaphorin-6C, humanhuman

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6CQ9H3T2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA6CQ9H3T2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA6CQ9H3T2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA6CQ9H3T2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA6CQ9H3T2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA6CQ9H3T2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA6CQ9H3T2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA6CQ9H3T2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA6CQ9H3T2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA6CQ9H3T2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA6CQ9H3T2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA6CQ9H3T2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA6CQ9H3T2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA6CQ9H3T2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA6CQ9H3T2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA6CQ9H3T2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA6CQ9H3T2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA6CQ9H3T2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA6CQ9H3T2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA6CQ9H3T2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA6CQ9H3T2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA6CQ9H3T2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA6CQ9H3T2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA6CQ9H3T2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEMA6CQ9H3T2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEMA6CQ9H3T2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA6CQ9H3T2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA6CQ9H3T2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA6CQ9H3T2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA6CQ9H3T2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA6CQ9H3T2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA6CQ9H3T2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA6CQ9H3T2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA6CQ9H3T2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA6CQ9H3T2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA6CQ9H3T2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA6CQ9H3T2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA6CQ9H3T2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA6CQ9H3T2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA6CQ9H3T2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA6CQ9H3T2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA6CQ9H3T2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA6CQ9H3T2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA6CQ9H3T2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA6CQ9H3T2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA6CQ9H3T2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA6CQ9H3T2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA6CQ9H3T2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA6CQ9H3T2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA6CQ9H3T2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA6CQ9H3T2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA6CQ9H3T2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA6CQ9H3T2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA6CQ9H3T2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA6CQ9H3T2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA6CQ9H3T2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA6CQ9H3T2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA6CQ9H3T2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA6CQ9H3T2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA6CQ9H3T2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA6CQ9H3T2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA6CQ9H3T2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA6CQ9H3T2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA6CQ9H3T2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA6CQ9H3T2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA6CQ9H3T2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA6CQ9H3T2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA6CQ9H3T2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA6CQ9H3T2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA6CQ9H3T2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA6CQ9H3T2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA6CQ9H3T2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA6CQ9H3T2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA6CQ9H3T2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA6CQ9H3T2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA6CQ9H3T2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA6CQ9H3T2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA6CQ9H3T2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA6CQ9H3T2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA6CQ9H3T2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA6CQ9H3T2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA6CQ9H3T2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA6CQ9H3T2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA6CQ9H3T2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA6CQ9H3T2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA6CQ9H3T2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA6CQ9H3T2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA6CQ9H3T2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA6CQ9H3T2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA6CQ9H3T2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA6CQ9H3T2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA6CQ9H3T2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA6CQ9H3T2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA6CQ9H3T2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA6CQ9H3T2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA6CQ9H3T2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA6CQ9H3T2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA6CQ9H3T2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA6CQ9H3T2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA6CQ9H3T2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms