Protein–RNA interactions for Protein: Q9H239

MMP28, Matrix metalloproteinase-28, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP28Q9H239 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP28Q9H239 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP28Q9H239 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP28Q9H239 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MMP28Q9H239 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP28Q9H239 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MMP28Q9H239 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MMP28Q9H239 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MMP28Q9H239 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP28Q9H239 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP28Q9H239 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP28Q9H239 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP28Q9H239 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP28Q9H239 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP28Q9H239 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP28Q9H239 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP28Q9H239 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP28Q9H239 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP28Q9H239 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP28Q9H239 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP28Q9H239 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP28Q9H239 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP28Q9H239 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP28Q9H239 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP28Q9H239 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP28Q9H239 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP28Q9H239 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP28Q9H239 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP28Q9H239 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP28Q9H239 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MMP28Q9H239 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP28Q9H239 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP28Q9H239 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP28Q9H239 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP28Q9H239 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP28Q9H239 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP28Q9H239 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP28Q9H239 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP28Q9H239 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP28Q9H239 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP28Q9H239 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP28Q9H239 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP28Q9H239 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP28Q9H239 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP28Q9H239 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP28Q9H239 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP28Q9H239 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP28Q9H239 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP28Q9H239 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP28Q9H239 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP28Q9H239 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP28Q9H239 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP28Q9H239 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP28Q9H239 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP28Q9H239 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP28Q9H239 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MMP28Q9H239 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MMP28Q9H239 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MMP28Q9H239 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MMP28Q9H239 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms