Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXP3Q9BZS1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXP3Q9BZS1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXP3Q9BZS1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXP3Q9BZS1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXP3Q9BZS1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXP3Q9BZS1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXP3Q9BZS1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FOXP3Q9BZS1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FOXP3Q9BZS1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXP3Q9BZS1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXP3Q9BZS1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXP3Q9BZS1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXP3Q9BZS1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXP3Q9BZS1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXP3Q9BZS1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXP3Q9BZS1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXP3Q9BZS1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXP3Q9BZS1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXP3Q9BZS1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXP3Q9BZS1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXP3Q9BZS1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXP3Q9BZS1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXP3Q9BZS1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXP3Q9BZS1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXP3Q9BZS1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXP3Q9BZS1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXP3Q9BZS1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXP3Q9BZS1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXP3Q9BZS1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXP3Q9BZS1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXP3Q9BZS1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXP3Q9BZS1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXP3Q9BZS1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXP3Q9BZS1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXP3Q9BZS1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXP3Q9BZS1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXP3Q9BZS1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXP3Q9BZS1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXP3Q9BZS1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXP3Q9BZS1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXP3Q9BZS1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXP3Q9BZS1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXP3Q9BZS1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXP3Q9BZS1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXP3Q9BZS1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXP3Q9BZS1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXP3Q9BZS1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXP3Q9BZS1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXP3Q9BZS1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXP3Q9BZS1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXP3Q9BZS1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXP3Q9BZS1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXP3Q9BZS1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXP3Q9BZS1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXP3Q9BZS1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXP3Q9BZS1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXP3Q9BZS1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXP3Q9BZS1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXP3Q9BZS1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXP3Q9BZS1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXP3Q9BZS1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXP3Q9BZS1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXP3Q9BZS1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXP3Q9BZS1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXP3Q9BZS1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXP3Q9BZS1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXP3Q9BZS1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXP3Q9BZS1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXP3Q9BZS1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXP3Q9BZS1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOXP3Q9BZS1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
FOXP3Q9BZS1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOXP3Q9BZS1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXP3Q9BZS1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXP3Q9BZS1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXP3Q9BZS1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXP3Q9BZS1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXP3Q9BZS1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXP3Q9BZS1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXP3Q9BZS1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXP3Q9BZS1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXP3Q9BZS1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXP3Q9BZS1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXP3Q9BZS1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOXP3Q9BZS1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOXP3Q9BZS1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXP3Q9BZS1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXP3Q9BZS1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXP3Q9BZS1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXP3Q9BZS1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXP3Q9BZS1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXP3Q9BZS1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOXP3Q9BZS1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXP3Q9BZS1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXP3Q9BZS1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXP3Q9BZS1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXP3Q9BZS1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXP3Q9BZS1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXP3Q9BZS1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms