Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV35

SLC25A23, Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-3, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A23Q9BV35 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC25A23Q9BV35 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC25A23Q9BV35 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC25A23Q9BV35 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC25A23Q9BV35 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC25A23Q9BV35 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC25A23Q9BV35 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC25A23Q9BV35 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC25A23Q9BV35 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC25A23Q9BV35 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC25A23Q9BV35 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC25A23Q9BV35 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC25A23Q9BV35 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC25A23Q9BV35 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC25A23Q9BV35 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC25A23Q9BV35 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC25A23Q9BV35 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC25A23Q9BV35 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC25A23Q9BV35 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC25A23Q9BV35 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC25A23Q9BV35 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC25A23Q9BV35 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC25A23Q9BV35 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC25A23Q9BV35 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC25A23Q9BV35 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC25A23Q9BV35 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC25A23Q9BV35 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC25A23Q9BV35 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC25A23Q9BV35 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC25A23Q9BV35 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC25A23Q9BV35 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC25A23Q9BV35 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC25A23Q9BV35 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC25A23Q9BV35 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC25A23Q9BV35 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC25A23Q9BV35 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC25A23Q9BV35 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC25A23Q9BV35 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC25A23Q9BV35 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC25A23Q9BV35 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC25A23Q9BV35 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC25A23Q9BV35 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC25A23Q9BV35 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC25A23Q9BV35 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC25A23Q9BV35 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC25A23Q9BV35 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC25A23Q9BV35 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC25A23Q9BV35 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC25A23Q9BV35 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC25A23Q9BV35 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC25A23Q9BV35 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC25A23Q9BV35 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC25A23Q9BV35 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC25A23Q9BV35 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC25A23Q9BV35 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC25A23Q9BV35 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC25A23Q9BV35 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC25A23Q9BV35 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC25A23Q9BV35 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC25A23Q9BV35 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC25A23Q9BV35 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC25A23Q9BV35 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC25A23Q9BV35 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms