Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM43Q9BTV4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM43Q9BTV4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM43Q9BTV4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM43Q9BTV4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM43Q9BTV4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM43Q9BTV4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM43Q9BTV4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM43Q9BTV4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM43Q9BTV4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM43Q9BTV4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM43Q9BTV4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM43Q9BTV4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM43Q9BTV4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM43Q9BTV4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM43Q9BTV4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM43Q9BTV4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM43Q9BTV4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM43Q9BTV4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM43Q9BTV4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM43Q9BTV4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM43Q9BTV4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM43Q9BTV4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM43Q9BTV4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM43Q9BTV4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM43Q9BTV4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM43Q9BTV4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM43Q9BTV4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM43Q9BTV4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM43Q9BTV4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM43Q9BTV4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM43Q9BTV4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM43Q9BTV4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM43Q9BTV4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM43Q9BTV4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM43Q9BTV4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM43Q9BTV4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM43Q9BTV4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM43Q9BTV4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM43Q9BTV4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM43Q9BTV4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM43Q9BTV4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM43Q9BTV4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM43Q9BTV4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM43Q9BTV4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM43Q9BTV4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM43Q9BTV4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM43Q9BTV4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM43Q9BTV4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM43Q9BTV4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM43Q9BTV4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM43Q9BTV4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM43Q9BTV4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM43Q9BTV4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM43Q9BTV4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM43Q9BTV4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM43Q9BTV4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM43Q9BTV4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM43Q9BTV4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM43Q9BTV4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM43Q9BTV4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM43Q9BTV4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM43Q9BTV4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM43Q9BTV4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM43Q9BTV4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM43Q9BTV4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM43Q9BTV4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM43Q9BTV4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM43Q9BTV4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM43Q9BTV4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM43Q9BTV4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM43Q9BTV4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM43Q9BTV4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM43Q9BTV4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM43Q9BTV4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM43Q9BTV4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM43Q9BTV4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM43Q9BTV4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM43Q9BTV4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM43Q9BTV4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM43Q9BTV4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM43Q9BTV4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM43Q9BTV4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM43Q9BTV4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM43Q9BTV4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM43Q9BTV4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM43Q9BTV4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM43Q9BTV4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM43Q9BTV4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM43Q9BTV4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM43Q9BTV4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM43Q9BTV4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM43Q9BTV4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM43Q9BTV4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM43Q9BTV4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM43Q9BTV4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM43Q9BTV4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM43Q9BTV4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM43Q9BTV4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM43Q9BTV4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms