Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A3Q9BRY0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A3Q9BRY0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A3Q9BRY0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A3Q9BRY0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC39A3Q9BRY0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC39A3Q9BRY0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC39A3Q9BRY0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC39A3Q9BRY0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC39A3Q9BRY0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC39A3Q9BRY0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A3Q9BRY0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A3Q9BRY0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A3Q9BRY0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A3Q9BRY0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A3Q9BRY0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A3Q9BRY0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A3Q9BRY0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A3Q9BRY0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A3Q9BRY0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A3Q9BRY0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A3Q9BRY0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A3Q9BRY0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A3Q9BRY0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A3Q9BRY0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A3Q9BRY0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A3Q9BRY0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A3Q9BRY0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A3Q9BRY0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A3Q9BRY0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A3Q9BRY0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A3Q9BRY0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A3Q9BRY0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A3Q9BRY0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A3Q9BRY0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A3Q9BRY0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC39A3Q9BRY0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC39A3Q9BRY0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC39A3Q9BRY0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC39A3Q9BRY0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC39A3Q9BRY0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC39A3Q9BRY0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC39A3Q9BRY0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC39A3Q9BRY0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC39A3Q9BRY0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC39A3Q9BRY0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC39A3Q9BRY0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC39A3Q9BRY0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC39A3Q9BRY0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC39A3Q9BRY0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC39A3Q9BRY0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC39A3Q9BRY0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC39A3Q9BRY0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC39A3Q9BRY0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC39A3Q9BRY0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC39A3Q9BRY0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC39A3Q9BRY0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC39A3Q9BRY0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC39A3Q9BRY0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC39A3Q9BRY0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC39A3Q9BRY0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC39A3Q9BRY0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC39A3Q9BRY0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC39A3Q9BRY0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC39A3Q9BRY0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC39A3Q9BRY0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC39A3Q9BRY0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC39A3Q9BRY0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC39A3Q9BRY0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC39A3Q9BRY0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC39A3Q9BRY0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC39A3Q9BRY0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC39A3Q9BRY0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC39A3Q9BRY0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC39A3Q9BRY0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC39A3Q9BRY0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC39A3Q9BRY0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC39A3Q9BRY0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC39A3Q9BRY0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC39A3Q9BRY0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC39A3Q9BRY0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC39A3Q9BRY0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC39A3Q9BRY0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC39A3Q9BRY0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC39A3Q9BRY0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC39A3Q9BRY0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC39A3Q9BRY0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC39A3Q9BRY0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC39A3Q9BRY0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC39A3Q9BRY0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC39A3Q9BRY0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC39A3Q9BRY0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC39A3Q9BRY0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC39A3Q9BRY0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC39A3Q9BRY0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A3Q9BRY0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A3Q9BRY0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A3Q9BRY0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A3Q9BRY0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A3Q9BRY0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms