Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK3

ZNF607, Zinc finger protein 607, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF607Q96SK3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF607Q96SK3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF607Q96SK3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF607Q96SK3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF607Q96SK3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF607Q96SK3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF607Q96SK3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF607Q96SK3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF607Q96SK3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF607Q96SK3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF607Q96SK3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF607Q96SK3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF607Q96SK3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF607Q96SK3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF607Q96SK3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF607Q96SK3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF607Q96SK3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF607Q96SK3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF607Q96SK3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF607Q96SK3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF607Q96SK3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF607Q96SK3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF607Q96SK3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF607Q96SK3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF607Q96SK3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF607Q96SK3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF607Q96SK3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF607Q96SK3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF607Q96SK3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF607Q96SK3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF607Q96SK3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF607Q96SK3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF607Q96SK3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF607Q96SK3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF607Q96SK3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF607Q96SK3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF607Q96SK3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF607Q96SK3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF607Q96SK3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF607Q96SK3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF607Q96SK3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF607Q96SK3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF607Q96SK3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF607Q96SK3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF607Q96SK3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF607Q96SK3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF607Q96SK3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF607Q96SK3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF607Q96SK3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF607Q96SK3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF607Q96SK3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF607Q96SK3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF607Q96SK3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF607Q96SK3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF607Q96SK3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF607Q96SK3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF607Q96SK3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF607Q96SK3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF607Q96SK3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF607Q96SK3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF607Q96SK3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF607Q96SK3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF607Q96SK3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF607Q96SK3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF607Q96SK3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF607Q96SK3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF607Q96SK3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF607Q96SK3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF607Q96SK3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF607Q96SK3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF607Q96SK3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF607Q96SK3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF607Q96SK3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF607Q96SK3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF607Q96SK3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF607Q96SK3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF607Q96SK3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF607Q96SK3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF607Q96SK3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF607Q96SK3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF607Q96SK3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF607Q96SK3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF607Q96SK3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF607Q96SK3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF607Q96SK3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF607Q96SK3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF607Q96SK3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF607Q96SK3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF607Q96SK3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF607Q96SK3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF607Q96SK3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF607Q96SK3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF607Q96SK3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF607Q96SK3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF607Q96SK3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF607Q96SK3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF607Q96SK3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF607Q96SK3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF607Q96SK3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF607Q96SK3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms