Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF396Q96N95 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF396Q96N95 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF396Q96N95 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF396Q96N95 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF396Q96N95 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF396Q96N95 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF396Q96N95 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF396Q96N95 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF396Q96N95 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF396Q96N95 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF396Q96N95 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF396Q96N95 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF396Q96N95 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF396Q96N95 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF396Q96N95 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF396Q96N95 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF396Q96N95 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF396Q96N95 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF396Q96N95 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF396Q96N95 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF396Q96N95 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF396Q96N95 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZNF396Q96N95 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF396Q96N95 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF396Q96N95 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF396Q96N95 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF396Q96N95 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF396Q96N95 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF396Q96N95 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF396Q96N95 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF396Q96N95 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF396Q96N95 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF396Q96N95 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF396Q96N95 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF396Q96N95 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF396Q96N95 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF396Q96N95 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF396Q96N95 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF396Q96N95 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF396Q96N95 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF396Q96N95 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF396Q96N95 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF396Q96N95 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF396Q96N95 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF396Q96N95 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF396Q96N95 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF396Q96N95 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF396Q96N95 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF396Q96N95 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF396Q96N95 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF396Q96N95 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF396Q96N95 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF396Q96N95 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF396Q96N95 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF396Q96N95 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF396Q96N95 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF396Q96N95 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF396Q96N95 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF396Q96N95 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF396Q96N95 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF396Q96N95 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF396Q96N95 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF396Q96N95 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF396Q96N95 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF396Q96N95 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF396Q96N95 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF396Q96N95 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF396Q96N95 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF396Q96N95 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF396Q96N95 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF396Q96N95 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF396Q96N95 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF396Q96N95 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF396Q96N95 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF396Q96N95 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF396Q96N95 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF396Q96N95 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZNF396Q96N95 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZNF396Q96N95 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZNF396Q96N95 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZNF396Q96N95 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF396Q96N95 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF396Q96N95 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF396Q96N95 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF396Q96N95 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF396Q96N95 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF396Q96N95 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF396Q96N95 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF396Q96N95 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF396Q96N95 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF396Q96N95 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF396Q96N95 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF396Q96N95 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF396Q96N95 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF396Q96N95 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF396Q96N95 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF396Q96N95 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF396Q96N95 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF396Q96N95 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms