Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SGSM3Q96HU1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SGSM3Q96HU1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SGSM3Q96HU1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SGSM3Q96HU1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SGSM3Q96HU1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SGSM3Q96HU1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SGSM3Q96HU1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SGSM3Q96HU1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SGSM3Q96HU1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SGSM3Q96HU1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SGSM3Q96HU1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SGSM3Q96HU1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SGSM3Q96HU1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SGSM3Q96HU1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SGSM3Q96HU1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SGSM3Q96HU1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGSM3Q96HU1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGSM3Q96HU1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SGSM3Q96HU1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SGSM3Q96HU1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SGSM3Q96HU1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SGSM3Q96HU1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SGSM3Q96HU1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SGSM3Q96HU1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SGSM3Q96HU1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SGSM3Q96HU1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SGSM3Q96HU1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SGSM3Q96HU1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SGSM3Q96HU1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SGSM3Q96HU1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SGSM3Q96HU1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SGSM3Q96HU1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SGSM3Q96HU1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SGSM3Q96HU1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SGSM3Q96HU1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SGSM3Q96HU1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SGSM3Q96HU1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SGSM3Q96HU1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SGSM3Q96HU1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SGSM3Q96HU1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SGSM3Q96HU1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SGSM3Q96HU1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SGSM3Q96HU1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SGSM3Q96HU1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SGSM3Q96HU1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SGSM3Q96HU1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SGSM3Q96HU1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SGSM3Q96HU1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SGSM3Q96HU1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SGSM3Q96HU1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SGSM3Q96HU1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SGSM3Q96HU1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SGSM3Q96HU1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SGSM3Q96HU1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SGSM3Q96HU1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SGSM3Q96HU1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SGSM3Q96HU1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SGSM3Q96HU1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SGSM3Q96HU1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SGSM3Q96HU1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SGSM3Q96HU1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SGSM3Q96HU1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SGSM3Q96HU1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGSM3Q96HU1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGSM3Q96HU1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGSM3Q96HU1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGSM3Q96HU1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGSM3Q96HU1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGSM3Q96HU1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGSM3Q96HU1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGSM3Q96HU1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGSM3Q96HU1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGSM3Q96HU1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGSM3Q96HU1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGSM3Q96HU1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGSM3Q96HU1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SGSM3Q96HU1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SGSM3Q96HU1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SGSM3Q96HU1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SGSM3Q96HU1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SGSM3Q96HU1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SGSM3Q96HU1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SGSM3Q96HU1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SGSM3Q96HU1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SGSM3Q96HU1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SGSM3Q96HU1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SGSM3Q96HU1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SGSM3Q96HU1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGSM3Q96HU1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGSM3Q96HU1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGSM3Q96HU1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGSM3Q96HU1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGSM3Q96HU1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGSM3Q96HU1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGSM3Q96HU1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SGSM3Q96HU1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SGSM3Q96HU1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SGSM3Q96HU1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SGSM3Q96HU1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms