Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL29Q96CT2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL29Q96CT2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KLHL29Q96CT2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KLHL29Q96CT2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KLHL29Q96CT2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KLHL29Q96CT2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL29Q96CT2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL29Q96CT2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL29Q96CT2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL29Q96CT2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL29Q96CT2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL29Q96CT2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL29Q96CT2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL29Q96CT2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL29Q96CT2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL29Q96CT2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL29Q96CT2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL29Q96CT2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL29Q96CT2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL29Q96CT2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL29Q96CT2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL29Q96CT2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL29Q96CT2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL29Q96CT2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL29Q96CT2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL29Q96CT2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL29Q96CT2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL29Q96CT2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL29Q96CT2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL29Q96CT2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL29Q96CT2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL29Q96CT2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL29Q96CT2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL29Q96CT2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL29Q96CT2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL29Q96CT2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL29Q96CT2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL29Q96CT2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL29Q96CT2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL29Q96CT2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL29Q96CT2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL29Q96CT2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL29Q96CT2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL29Q96CT2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL29Q96CT2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL29Q96CT2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL29Q96CT2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL29Q96CT2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL29Q96CT2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL29Q96CT2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL29Q96CT2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL29Q96CT2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL29Q96CT2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL29Q96CT2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL29Q96CT2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL29Q96CT2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL29Q96CT2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL29Q96CT2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL29Q96CT2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL29Q96CT2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL29Q96CT2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL29Q96CT2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL29Q96CT2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL29Q96CT2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL29Q96CT2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL29Q96CT2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL29Q96CT2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL29Q96CT2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL29Q96CT2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL29Q96CT2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL29Q96CT2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL29Q96CT2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL29Q96CT2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL29Q96CT2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL29Q96CT2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL29Q96CT2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL29Q96CT2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL29Q96CT2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL29Q96CT2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL29Q96CT2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL29Q96CT2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL29Q96CT2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL29Q96CT2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL29Q96CT2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL29Q96CT2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL29Q96CT2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KLHL29Q96CT2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL29Q96CT2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL29Q96CT2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL29Q96CT2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL29Q96CT2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL29Q96CT2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL29Q96CT2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL29Q96CT2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL29Q96CT2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL29Q96CT2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL29Q96CT2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL29Q96CT2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL29Q96CT2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms