Protein–RNA interactions for Protein: Q92930

RAB8B, Ras-related protein Rab-8B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB8BQ92930 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB8BQ92930 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB8BQ92930 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB8BQ92930 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB8BQ92930 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB8BQ92930 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB8BQ92930 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB8BQ92930 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB8BQ92930 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB8BQ92930 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB8BQ92930 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB8BQ92930 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB8BQ92930 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB8BQ92930 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB8BQ92930 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB8BQ92930 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB8BQ92930 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB8BQ92930 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB8BQ92930 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB8BQ92930 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB8BQ92930 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB8BQ92930 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB8BQ92930 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB8BQ92930 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB8BQ92930 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB8BQ92930 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB8BQ92930 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB8BQ92930 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB8BQ92930 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB8BQ92930 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB8BQ92930 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB8BQ92930 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB8BQ92930 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB8BQ92930 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB8BQ92930 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB8BQ92930 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB8BQ92930 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB8BQ92930 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB8BQ92930 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB8BQ92930 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB8BQ92930 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB8BQ92930 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB8BQ92930 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB8BQ92930 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB8BQ92930 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB8BQ92930 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB8BQ92930 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB8BQ92930 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB8BQ92930 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB8BQ92930 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB8BQ92930 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB8BQ92930 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB8BQ92930 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB8BQ92930 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB8BQ92930 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB8BQ92930 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB8BQ92930 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB8BQ92930 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB8BQ92930 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB8BQ92930 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB8BQ92930 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB8BQ92930 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB8BQ92930 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB8BQ92930 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB8BQ92930 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB8BQ92930 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB8BQ92930 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB8BQ92930 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB8BQ92930 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB8BQ92930 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB8BQ92930 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB8BQ92930 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB8BQ92930 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB8BQ92930 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB8BQ92930 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB8BQ92930 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB8BQ92930 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB8BQ92930 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB8BQ92930 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB8BQ92930 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB8BQ92930 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB8BQ92930 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB8BQ92930 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB8BQ92930 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB8BQ92930 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB8BQ92930 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB8BQ92930 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB8BQ92930 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB8BQ92930 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB8BQ92930 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB8BQ92930 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB8BQ92930 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB8BQ92930 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB8BQ92930 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB8BQ92930 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB8BQ92930 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB8BQ92930 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB8BQ92930 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB8BQ92930 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB8BQ92930 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms