Protein–RNA interactions for Protein: Q92903

CDS1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDS1Q92903 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDS1Q92903 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDS1Q92903 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDS1Q92903 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDS1Q92903 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDS1Q92903 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDS1Q92903 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDS1Q92903 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDS1Q92903 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDS1Q92903 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDS1Q92903 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDS1Q92903 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDS1Q92903 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CDS1Q92903 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDS1Q92903 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDS1Q92903 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDS1Q92903 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDS1Q92903 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDS1Q92903 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDS1Q92903 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDS1Q92903 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDS1Q92903 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDS1Q92903 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDS1Q92903 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDS1Q92903 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDS1Q92903 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDS1Q92903 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDS1Q92903 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDS1Q92903 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDS1Q92903 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDS1Q92903 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDS1Q92903 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDS1Q92903 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDS1Q92903 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDS1Q92903 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDS1Q92903 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDS1Q92903 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDS1Q92903 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDS1Q92903 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDS1Q92903 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDS1Q92903 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDS1Q92903 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDS1Q92903 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDS1Q92903 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDS1Q92903 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDS1Q92903 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDS1Q92903 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDS1Q92903 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDS1Q92903 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDS1Q92903 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDS1Q92903 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDS1Q92903 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDS1Q92903 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDS1Q92903 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDS1Q92903 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDS1Q92903 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDS1Q92903 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDS1Q92903 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDS1Q92903 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDS1Q92903 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDS1Q92903 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDS1Q92903 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDS1Q92903 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDS1Q92903 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDS1Q92903 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDS1Q92903 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDS1Q92903 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDS1Q92903 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDS1Q92903 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDS1Q92903 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDS1Q92903 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDS1Q92903 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDS1Q92903 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDS1Q92903 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDS1Q92903 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDS1Q92903 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDS1Q92903 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDS1Q92903 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDS1Q92903 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDS1Q92903 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDS1Q92903 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDS1Q92903 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDS1Q92903 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDS1Q92903 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDS1Q92903 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDS1Q92903 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDS1Q92903 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDS1Q92903 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDS1Q92903 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDS1Q92903 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDS1Q92903 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDS1Q92903 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDS1Q92903 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDS1Q92903 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDS1Q92903 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDS1Q92903 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDS1Q92903 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDS1Q92903 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDS1Q92903 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDS1Q92903 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms