Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD1

RAB2B, Ras-related protein Rab-2B, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2BQ8WUD1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB2BQ8WUD1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB2BQ8WUD1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB2BQ8WUD1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB2BQ8WUD1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB2BQ8WUD1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB2BQ8WUD1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB2BQ8WUD1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB2BQ8WUD1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB2BQ8WUD1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB2BQ8WUD1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB2BQ8WUD1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB2BQ8WUD1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB2BQ8WUD1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB2BQ8WUD1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB2BQ8WUD1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB2BQ8WUD1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB2BQ8WUD1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB2BQ8WUD1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB2BQ8WUD1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB2BQ8WUD1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB2BQ8WUD1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB2BQ8WUD1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB2BQ8WUD1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB2BQ8WUD1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB2BQ8WUD1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB2BQ8WUD1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB2BQ8WUD1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB2BQ8WUD1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB2BQ8WUD1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB2BQ8WUD1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB2BQ8WUD1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB2BQ8WUD1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB2BQ8WUD1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB2BQ8WUD1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB2BQ8WUD1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB2BQ8WUD1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB2BQ8WUD1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB2BQ8WUD1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB2BQ8WUD1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB2BQ8WUD1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB2BQ8WUD1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB2BQ8WUD1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB2BQ8WUD1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB2BQ8WUD1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB2BQ8WUD1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB2BQ8WUD1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB2BQ8WUD1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB2BQ8WUD1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB2BQ8WUD1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB2BQ8WUD1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB2BQ8WUD1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB2BQ8WUD1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB2BQ8WUD1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB2BQ8WUD1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB2BQ8WUD1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB2BQ8WUD1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB2BQ8WUD1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB2BQ8WUD1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB2BQ8WUD1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB2BQ8WUD1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB2BQ8WUD1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB2BQ8WUD1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB2BQ8WUD1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB2BQ8WUD1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB2BQ8WUD1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB2BQ8WUD1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB2BQ8WUD1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB2BQ8WUD1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB2BQ8WUD1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB2BQ8WUD1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB2BQ8WUD1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB2BQ8WUD1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB2BQ8WUD1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB2BQ8WUD1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB2BQ8WUD1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB2BQ8WUD1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB2BQ8WUD1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RAB2BQ8WUD1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB2BQ8WUD1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB2BQ8WUD1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB2BQ8WUD1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB2BQ8WUD1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB2BQ8WUD1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB2BQ8WUD1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB2BQ8WUD1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB2BQ8WUD1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB2BQ8WUD1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB2BQ8WUD1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB2BQ8WUD1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB2BQ8WUD1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB2BQ8WUD1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB2BQ8WUD1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB2BQ8WUD1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB2BQ8WUD1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB2BQ8WUD1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB2BQ8WUD1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB2BQ8WUD1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB2BQ8WUD1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB2BQ8WUD1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms