Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEZ2

VPS37A, Vacuolar protein sorting-associated protein 37A, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37AQ8NEZ2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS37AQ8NEZ2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37AQ8NEZ2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37AQ8NEZ2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37AQ8NEZ2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37AQ8NEZ2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37AQ8NEZ2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37AQ8NEZ2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37AQ8NEZ2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37AQ8NEZ2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37AQ8NEZ2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37AQ8NEZ2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37AQ8NEZ2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37AQ8NEZ2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37AQ8NEZ2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS37AQ8NEZ2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS37AQ8NEZ2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS37AQ8NEZ2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37AQ8NEZ2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37AQ8NEZ2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37AQ8NEZ2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37AQ8NEZ2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37AQ8NEZ2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37AQ8NEZ2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS37AQ8NEZ2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS37AQ8NEZ2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS37AQ8NEZ2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS37AQ8NEZ2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS37AQ8NEZ2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS37AQ8NEZ2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37AQ8NEZ2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37AQ8NEZ2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37AQ8NEZ2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37AQ8NEZ2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37AQ8NEZ2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS37AQ8NEZ2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS37AQ8NEZ2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS37AQ8NEZ2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS37AQ8NEZ2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS37AQ8NEZ2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS37AQ8NEZ2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS37AQ8NEZ2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS37AQ8NEZ2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS37AQ8NEZ2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS37AQ8NEZ2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS37AQ8NEZ2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS37AQ8NEZ2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS37AQ8NEZ2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS37AQ8NEZ2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS37AQ8NEZ2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS37AQ8NEZ2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS37AQ8NEZ2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS37AQ8NEZ2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS37AQ8NEZ2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS37AQ8NEZ2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS37AQ8NEZ2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS37AQ8NEZ2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS37AQ8NEZ2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS37AQ8NEZ2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS37AQ8NEZ2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS37AQ8NEZ2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS37AQ8NEZ2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS37AQ8NEZ2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS37AQ8NEZ2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS37AQ8NEZ2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS37AQ8NEZ2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS37AQ8NEZ2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS37AQ8NEZ2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS37AQ8NEZ2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS37AQ8NEZ2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS37AQ8NEZ2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS37AQ8NEZ2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS37AQ8NEZ2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS37AQ8NEZ2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS37AQ8NEZ2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS37AQ8NEZ2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS37AQ8NEZ2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS37AQ8NEZ2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS37AQ8NEZ2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VPS37AQ8NEZ2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS37AQ8NEZ2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS37AQ8NEZ2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS37AQ8NEZ2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS37AQ8NEZ2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS37AQ8NEZ2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS37AQ8NEZ2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS37AQ8NEZ2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS37AQ8NEZ2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS37AQ8NEZ2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS37AQ8NEZ2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS37AQ8NEZ2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37AQ8NEZ2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37AQ8NEZ2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37AQ8NEZ2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37AQ8NEZ2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS37AQ8NEZ2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS37AQ8NEZ2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS37AQ8NEZ2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS37AQ8NEZ2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS37AQ8NEZ2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms