Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNNM3Q8NE01 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNNM3Q8NE01 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CNNM3Q8NE01 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNNM3Q8NE01 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNNM3Q8NE01 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNNM3Q8NE01 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNNM3Q8NE01 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNNM3Q8NE01 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNNM3Q8NE01 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNNM3Q8NE01 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNNM3Q8NE01 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNNM3Q8NE01 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNNM3Q8NE01 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CNNM3Q8NE01 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNNM3Q8NE01 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNNM3Q8NE01 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNNM3Q8NE01 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CNNM3Q8NE01 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNNM3Q8NE01 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNNM3Q8NE01 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNNM3Q8NE01 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNNM3Q8NE01 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNNM3Q8NE01 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNNM3Q8NE01 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNNM3Q8NE01 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNNM3Q8NE01 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNNM3Q8NE01 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNNM3Q8NE01 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNNM3Q8NE01 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNNM3Q8NE01 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNNM3Q8NE01 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNNM3Q8NE01 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNNM3Q8NE01 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNNM3Q8NE01 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNNM3Q8NE01 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CNNM3Q8NE01 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CNNM3Q8NE01 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CNNM3Q8NE01 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CNNM3Q8NE01 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNNM3Q8NE01 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNNM3Q8NE01 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNNM3Q8NE01 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNNM3Q8NE01 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNNM3Q8NE01 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNNM3Q8NE01 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNNM3Q8NE01 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CNNM3Q8NE01 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNNM3Q8NE01 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNNM3Q8NE01 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CNNM3Q8NE01 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNNM3Q8NE01 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNNM3Q8NE01 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNNM3Q8NE01 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNNM3Q8NE01 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNNM3Q8NE01 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNNM3Q8NE01 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNNM3Q8NE01 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CNNM3Q8NE01 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CNNM3Q8NE01 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CNNM3Q8NE01 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CNNM3Q8NE01 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CNNM3Q8NE01 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CNNM3Q8NE01 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CNNM3Q8NE01 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CNNM3Q8NE01 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CNNM3Q8NE01 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CNNM3Q8NE01 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CNNM3Q8NE01 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNNM3Q8NE01 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNNM3Q8NE01 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNNM3Q8NE01 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNNM3Q8NE01 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNNM3Q8NE01 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNNM3Q8NE01 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNNM3Q8NE01 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNNM3Q8NE01 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNNM3Q8NE01 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CNNM3Q8NE01 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNNM3Q8NE01 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CNNM3Q8NE01 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNNM3Q8NE01 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNNM3Q8NE01 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNNM3Q8NE01 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNNM3Q8NE01 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNNM3Q8NE01 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CNNM3Q8NE01 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNNM3Q8NE01 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNNM3Q8NE01 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNNM3Q8NE01 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNNM3Q8NE01 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNNM3Q8NE01 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNNM3Q8NE01 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNNM3Q8NE01 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CNNM3Q8NE01 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNNM3Q8NE01 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNNM3Q8NE01 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNNM3Q8NE01 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNNM3Q8NE01 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNNM3Q8NE01 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
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