Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSGALNACT2Q8N6G5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSGALNACT2Q8N6G5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSGALNACT2Q8N6G5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSGALNACT2Q8N6G5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSGALNACT2Q8N6G5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSGALNACT2Q8N6G5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSGALNACT2Q8N6G5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSGALNACT2Q8N6G5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSGALNACT2Q8N6G5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CSGALNACT2Q8N6G5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSGALNACT2Q8N6G5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSGALNACT2Q8N6G5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSGALNACT2Q8N6G5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSGALNACT2Q8N6G5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSGALNACT2Q8N6G5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSGALNACT2Q8N6G5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSGALNACT2Q8N6G5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSGALNACT2Q8N6G5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSGALNACT2Q8N6G5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSGALNACT2Q8N6G5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSGALNACT2Q8N6G5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSGALNACT2Q8N6G5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSGALNACT2Q8N6G5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSGALNACT2Q8N6G5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSGALNACT2Q8N6G5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSGALNACT2Q8N6G5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSGALNACT2Q8N6G5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSGALNACT2Q8N6G5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CSGALNACT2Q8N6G5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSGALNACT2Q8N6G5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSGALNACT2Q8N6G5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSGALNACT2Q8N6G5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSGALNACT2Q8N6G5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSGALNACT2Q8N6G5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CSGALNACT2Q8N6G5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSGALNACT2Q8N6G5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSGALNACT2Q8N6G5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSGALNACT2Q8N6G5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSGALNACT2Q8N6G5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CSGALNACT2Q8N6G5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSGALNACT2Q8N6G5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSGALNACT2Q8N6G5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSGALNACT2Q8N6G5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CSGALNACT2Q8N6G5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSGALNACT2Q8N6G5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSGALNACT2Q8N6G5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSGALNACT2Q8N6G5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSGALNACT2Q8N6G5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSGALNACT2Q8N6G5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CSGALNACT2Q8N6G5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSGALNACT2Q8N6G5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CSGALNACT2Q8N6G5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSGALNACT2Q8N6G5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSGALNACT2Q8N6G5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
CSGALNACT2Q8N6G5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSGALNACT2Q8N6G5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSGALNACT2Q8N6G5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSGALNACT2Q8N6G5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSGALNACT2Q8N6G5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSGALNACT2Q8N6G5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSGALNACT2Q8N6G5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSGALNACT2Q8N6G5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSGALNACT2Q8N6G5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CSGALNACT2Q8N6G5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSGALNACT2Q8N6G5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSGALNACT2Q8N6G5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CSGALNACT2Q8N6G5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSGALNACT2Q8N6G5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSGALNACT2Q8N6G5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSGALNACT2Q8N6G5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSGALNACT2Q8N6G5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSGALNACT2Q8N6G5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSGALNACT2Q8N6G5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSGALNACT2Q8N6G5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSGALNACT2Q8N6G5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSGALNACT2Q8N6G5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSGALNACT2Q8N6G5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSGALNACT2Q8N6G5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSGALNACT2Q8N6G5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSGALNACT2Q8N6G5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSGALNACT2Q8N6G5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSGALNACT2Q8N6G5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSGALNACT2Q8N6G5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSGALNACT2Q8N6G5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSGALNACT2Q8N6G5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSGALNACT2Q8N6G5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSGALNACT2Q8N6G5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms