Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4F7

RNF175, RING finger protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF175Q8N4F7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF175Q8N4F7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF175Q8N4F7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF175Q8N4F7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF175Q8N4F7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF175Q8N4F7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF175Q8N4F7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF175Q8N4F7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF175Q8N4F7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF175Q8N4F7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF175Q8N4F7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF175Q8N4F7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF175Q8N4F7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF175Q8N4F7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF175Q8N4F7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF175Q8N4F7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF175Q8N4F7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF175Q8N4F7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF175Q8N4F7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF175Q8N4F7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF175Q8N4F7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF175Q8N4F7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF175Q8N4F7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF175Q8N4F7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF175Q8N4F7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF175Q8N4F7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF175Q8N4F7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF175Q8N4F7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF175Q8N4F7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF175Q8N4F7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF175Q8N4F7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF175Q8N4F7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF175Q8N4F7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF175Q8N4F7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF175Q8N4F7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF175Q8N4F7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF175Q8N4F7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF175Q8N4F7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF175Q8N4F7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF175Q8N4F7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF175Q8N4F7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF175Q8N4F7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF175Q8N4F7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF175Q8N4F7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF175Q8N4F7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF175Q8N4F7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF175Q8N4F7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF175Q8N4F7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF175Q8N4F7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF175Q8N4F7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF175Q8N4F7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF175Q8N4F7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF175Q8N4F7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF175Q8N4F7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF175Q8N4F7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF175Q8N4F7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF175Q8N4F7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF175Q8N4F7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF175Q8N4F7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF175Q8N4F7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF175Q8N4F7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF175Q8N4F7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF175Q8N4F7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF175Q8N4F7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF175Q8N4F7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF175Q8N4F7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF175Q8N4F7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF175Q8N4F7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF175Q8N4F7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF175Q8N4F7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF175Q8N4F7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF175Q8N4F7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF175Q8N4F7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF175Q8N4F7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF175Q8N4F7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF175Q8N4F7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF175Q8N4F7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF175Q8N4F7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF175Q8N4F7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF175Q8N4F7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF175Q8N4F7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF175Q8N4F7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF175Q8N4F7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF175Q8N4F7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF175Q8N4F7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF175Q8N4F7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF175Q8N4F7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF175Q8N4F7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF175Q8N4F7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF175Q8N4F7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF175Q8N4F7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF175Q8N4F7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF175Q8N4F7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF175Q8N4F7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF175Q8N4F7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF175Q8N4F7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF175Q8N4F7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF175Q8N4F7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF175Q8N4F7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF175Q8N4F7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms