Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN4Q8IWV2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN4Q8IWV2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN4Q8IWV2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTN4Q8IWV2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTN4Q8IWV2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN4Q8IWV2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN4Q8IWV2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTN4Q8IWV2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CNTN4Q8IWV2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CNTN4Q8IWV2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN4Q8IWV2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN4Q8IWV2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN4Q8IWV2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN4Q8IWV2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN4Q8IWV2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN4Q8IWV2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN4Q8IWV2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN4Q8IWV2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN4Q8IWV2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTN4Q8IWV2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTN4Q8IWV2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTN4Q8IWV2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN4Q8IWV2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN4Q8IWV2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN4Q8IWV2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTN4Q8IWV2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTN4Q8IWV2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTN4Q8IWV2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTN4Q8IWV2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTN4Q8IWV2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTN4Q8IWV2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTN4Q8IWV2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTN4Q8IWV2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTN4Q8IWV2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTN4Q8IWV2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTN4Q8IWV2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTN4Q8IWV2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN4Q8IWV2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN4Q8IWV2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN4Q8IWV2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN4Q8IWV2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN4Q8IWV2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN4Q8IWV2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN4Q8IWV2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN4Q8IWV2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN4Q8IWV2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN4Q8IWV2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN4Q8IWV2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN4Q8IWV2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN4Q8IWV2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN4Q8IWV2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTN4Q8IWV2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTN4Q8IWV2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTN4Q8IWV2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTN4Q8IWV2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN4Q8IWV2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN4Q8IWV2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN4Q8IWV2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN4Q8IWV2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN4Q8IWV2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN4Q8IWV2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN4Q8IWV2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN4Q8IWV2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTN4Q8IWV2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTN4Q8IWV2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTN4Q8IWV2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTN4Q8IWV2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CNTN4Q8IWV2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CNTN4Q8IWV2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTN4Q8IWV2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTN4Q8IWV2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTN4Q8IWV2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTN4Q8IWV2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN4Q8IWV2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN4Q8IWV2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN4Q8IWV2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN4Q8IWV2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTN4Q8IWV2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTN4Q8IWV2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTN4Q8IWV2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN4Q8IWV2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN4Q8IWV2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN4Q8IWV2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN4Q8IWV2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN4Q8IWV2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN4Q8IWV2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN4Q8IWV2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNTN4Q8IWV2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNTN4Q8IWV2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTN4Q8IWV2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTN4Q8IWV2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTN4Q8IWV2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTN4Q8IWV2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTN4Q8IWV2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN4Q8IWV2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN4Q8IWV2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN4Q8IWV2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN4Q8IWV2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN4Q8IWV2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms