Protein–RNA interactions for Protein: Q86UB9

TMEM135, Transmembrane protein 135, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM135Q86UB9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM135Q86UB9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM135Q86UB9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM135Q86UB9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM135Q86UB9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM135Q86UB9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM135Q86UB9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM135Q86UB9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM135Q86UB9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM135Q86UB9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM135Q86UB9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM135Q86UB9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM135Q86UB9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM135Q86UB9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM135Q86UB9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM135Q86UB9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM135Q86UB9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM135Q86UB9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TMEM135Q86UB9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM135Q86UB9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM135Q86UB9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM135Q86UB9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM135Q86UB9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM135Q86UB9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM135Q86UB9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM135Q86UB9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM135Q86UB9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM135Q86UB9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM135Q86UB9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM135Q86UB9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM135Q86UB9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM135Q86UB9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM135Q86UB9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM135Q86UB9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM135Q86UB9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM135Q86UB9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM135Q86UB9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM135Q86UB9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM135Q86UB9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM135Q86UB9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM135Q86UB9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM135Q86UB9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM135Q86UB9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM135Q86UB9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM135Q86UB9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM135Q86UB9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM135Q86UB9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM135Q86UB9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM135Q86UB9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM135Q86UB9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM135Q86UB9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM135Q86UB9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM135Q86UB9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM135Q86UB9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM135Q86UB9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM135Q86UB9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM135Q86UB9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM135Q86UB9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM135Q86UB9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM135Q86UB9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM135Q86UB9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM135Q86UB9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM135Q86UB9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM135Q86UB9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM135Q86UB9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM135Q86UB9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM135Q86UB9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM135Q86UB9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM135Q86UB9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM135Q86UB9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM135Q86UB9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM135Q86UB9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM135Q86UB9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM135Q86UB9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM135Q86UB9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM135Q86UB9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM135Q86UB9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM135Q86UB9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM135Q86UB9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM135Q86UB9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM135Q86UB9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM135Q86UB9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM135Q86UB9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM135Q86UB9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM135Q86UB9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM135Q86UB9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM135Q86UB9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM135Q86UB9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM135Q86UB9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM135Q86UB9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM135Q86UB9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM135Q86UB9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM135Q86UB9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM135Q86UB9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM135Q86UB9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM135Q86UB9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM135Q86UB9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM135Q86UB9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM135Q86UB9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM135Q86UB9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms