Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF550Q7Z398 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF550Q7Z398 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF550Q7Z398 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF550Q7Z398 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF550Q7Z398 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF550Q7Z398 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF550Q7Z398 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF550Q7Z398 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF550Q7Z398 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF550Q7Z398 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF550Q7Z398 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF550Q7Z398 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF550Q7Z398 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF550Q7Z398 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF550Q7Z398 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF550Q7Z398 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF550Q7Z398 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF550Q7Z398 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF550Q7Z398 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF550Q7Z398 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF550Q7Z398 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF550Q7Z398 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF550Q7Z398 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF550Q7Z398 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF550Q7Z398 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF550Q7Z398 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF550Q7Z398 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF550Q7Z398 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF550Q7Z398 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF550Q7Z398 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF550Q7Z398 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF550Q7Z398 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF550Q7Z398 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF550Q7Z398 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF550Q7Z398 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF550Q7Z398 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF550Q7Z398 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF550Q7Z398 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF550Q7Z398 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF550Q7Z398 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF550Q7Z398 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF550Q7Z398 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF550Q7Z398 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF550Q7Z398 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF550Q7Z398 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF550Q7Z398 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF550Q7Z398 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF550Q7Z398 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF550Q7Z398 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF550Q7Z398 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF550Q7Z398 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF550Q7Z398 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF550Q7Z398 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF550Q7Z398 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF550Q7Z398 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF550Q7Z398 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF550Q7Z398 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF550Q7Z398 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF550Q7Z398 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF550Q7Z398 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF550Q7Z398 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF550Q7Z398 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF550Q7Z398 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF550Q7Z398 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF550Q7Z398 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF550Q7Z398 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF550Q7Z398 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF550Q7Z398 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF550Q7Z398 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF550Q7Z398 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF550Q7Z398 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF550Q7Z398 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF550Q7Z398 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF550Q7Z398 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF550Q7Z398 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF550Q7Z398 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF550Q7Z398 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF550Q7Z398 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF550Q7Z398 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF550Q7Z398 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF550Q7Z398 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF550Q7Z398 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF550Q7Z398 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF550Q7Z398 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF550Q7Z398 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF550Q7Z398 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF550Q7Z398 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF550Q7Z398 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF550Q7Z398 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF550Q7Z398 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF550Q7Z398 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF550Q7Z398 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF550Q7Z398 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF550Q7Z398 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF550Q7Z398 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF550Q7Z398 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF550Q7Z398 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF550Q7Z398 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF550Q7Z398 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms