Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RUFY3Q7L099 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
RUFY3Q7L099 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RUFY3Q7L099 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RUFY3Q7L099 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RUFY3Q7L099 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RUFY3Q7L099 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RUFY3Q7L099 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RUFY3Q7L099 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RUFY3Q7L099 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RUFY3Q7L099 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RUFY3Q7L099 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RUFY3Q7L099 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RUFY3Q7L099 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RUFY3Q7L099 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RUFY3Q7L099 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RUFY3Q7L099 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RUFY3Q7L099 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RUFY3Q7L099 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RUFY3Q7L099 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RUFY3Q7L099 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RUFY3Q7L099 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RUFY3Q7L099 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RUFY3Q7L099 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RUFY3Q7L099 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RUFY3Q7L099 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RUFY3Q7L099 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RUFY3Q7L099 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RUFY3Q7L099 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RUFY3Q7L099 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RUFY3Q7L099 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RUFY3Q7L099 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RUFY3Q7L099 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RUFY3Q7L099 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RUFY3Q7L099 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RUFY3Q7L099 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RUFY3Q7L099 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RUFY3Q7L099 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RUFY3Q7L099 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
RUFY3Q7L099 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RUFY3Q7L099 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RUFY3Q7L099 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RUFY3Q7L099 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RUFY3Q7L099 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RUFY3Q7L099 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
RUFY3Q7L099 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RUFY3Q7L099 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RUFY3Q7L099 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RUFY3Q7L099 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
RUFY3Q7L099 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RUFY3Q7L099 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RUFY3Q7L099 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RUFY3Q7L099 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RUFY3Q7L099 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RUFY3Q7L099 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RUFY3Q7L099 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RUFY3Q7L099 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
RUFY3Q7L099 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RUFY3Q7L099 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
RUFY3Q7L099 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RUFY3Q7L099 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RUFY3Q7L099 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RUFY3Q7L099 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RUFY3Q7L099 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RUFY3Q7L099 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
RUFY3Q7L099 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RUFY3Q7L099 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RUFY3Q7L099 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RUFY3Q7L099 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RUFY3Q7L099 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RUFY3Q7L099 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RUFY3Q7L099 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RUFY3Q7L099 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RUFY3Q7L099 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RUFY3Q7L099 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RUFY3Q7L099 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RUFY3Q7L099 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RUFY3Q7L099 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RUFY3Q7L099 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RUFY3Q7L099 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RUFY3Q7L099 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RUFY3Q7L099 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RUFY3Q7L099 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RUFY3Q7L099 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RUFY3Q7L099 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RUFY3Q7L099 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RUFY3Q7L099 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RUFY3Q7L099 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RUFY3Q7L099 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RUFY3Q7L099 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RUFY3Q7L099 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RUFY3Q7L099 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RUFY3Q7L099 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RUFY3Q7L099 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RUFY3Q7L099 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RUFY3Q7L099 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RUFY3Q7L099 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RUFY3Q7L099 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RUFY3Q7L099 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RUFY3Q7L099 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms