Protein–RNA interactions for Protein: Q70JA7

CHSY3, Chondroitin sulfate synthase 3, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY3Q70JA7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHSY3Q70JA7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHSY3Q70JA7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHSY3Q70JA7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHSY3Q70JA7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CHSY3Q70JA7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHSY3Q70JA7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHSY3Q70JA7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHSY3Q70JA7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHSY3Q70JA7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHSY3Q70JA7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHSY3Q70JA7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHSY3Q70JA7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHSY3Q70JA7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHSY3Q70JA7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHSY3Q70JA7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHSY3Q70JA7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHSY3Q70JA7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHSY3Q70JA7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHSY3Q70JA7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHSY3Q70JA7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHSY3Q70JA7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHSY3Q70JA7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHSY3Q70JA7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHSY3Q70JA7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHSY3Q70JA7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHSY3Q70JA7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHSY3Q70JA7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHSY3Q70JA7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHSY3Q70JA7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHSY3Q70JA7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHSY3Q70JA7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHSY3Q70JA7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHSY3Q70JA7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHSY3Q70JA7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHSY3Q70JA7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHSY3Q70JA7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHSY3Q70JA7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHSY3Q70JA7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHSY3Q70JA7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHSY3Q70JA7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHSY3Q70JA7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHSY3Q70JA7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHSY3Q70JA7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHSY3Q70JA7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHSY3Q70JA7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHSY3Q70JA7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHSY3Q70JA7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHSY3Q70JA7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHSY3Q70JA7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHSY3Q70JA7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHSY3Q70JA7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHSY3Q70JA7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHSY3Q70JA7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHSY3Q70JA7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHSY3Q70JA7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHSY3Q70JA7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHSY3Q70JA7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHSY3Q70JA7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHSY3Q70JA7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHSY3Q70JA7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHSY3Q70JA7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHSY3Q70JA7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHSY3Q70JA7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHSY3Q70JA7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHSY3Q70JA7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CHSY3Q70JA7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CHSY3Q70JA7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHSY3Q70JA7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHSY3Q70JA7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHSY3Q70JA7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHSY3Q70JA7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHSY3Q70JA7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHSY3Q70JA7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHSY3Q70JA7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHSY3Q70JA7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHSY3Q70JA7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHSY3Q70JA7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHSY3Q70JA7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHSY3Q70JA7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHSY3Q70JA7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHSY3Q70JA7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHSY3Q70JA7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHSY3Q70JA7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHSY3Q70JA7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHSY3Q70JA7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHSY3Q70JA7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHSY3Q70JA7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHSY3Q70JA7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHSY3Q70JA7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHSY3Q70JA7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHSY3Q70JA7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHSY3Q70JA7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHSY3Q70JA7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHSY3Q70JA7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHSY3Q70JA7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHSY3Q70JA7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CHSY3Q70JA7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHSY3Q70JA7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHSY3Q70JA7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms