Protein–RNA interactions for Protein: Q6P499

NIPAL3, NIPA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL3Q6P499 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIPAL3Q6P499 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIPAL3Q6P499 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIPAL3Q6P499 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIPAL3Q6P499 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIPAL3Q6P499 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIPAL3Q6P499 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIPAL3Q6P499 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIPAL3Q6P499 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIPAL3Q6P499 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIPAL3Q6P499 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIPAL3Q6P499 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIPAL3Q6P499 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIPAL3Q6P499 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPAL3Q6P499 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIPAL3Q6P499 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NIPAL3Q6P499 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NIPAL3Q6P499 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NIPAL3Q6P499 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPAL3Q6P499 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPAL3Q6P499 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPAL3Q6P499 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPAL3Q6P499 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NIPAL3Q6P499 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIPAL3Q6P499 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIPAL3Q6P499 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIPAL3Q6P499 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPAL3Q6P499 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPAL3Q6P499 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPAL3Q6P499 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPAL3Q6P499 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPAL3Q6P499 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPAL3Q6P499 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPAL3Q6P499 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPAL3Q6P499 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPAL3Q6P499 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPAL3Q6P499 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPAL3Q6P499 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPAL3Q6P499 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPAL3Q6P499 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPAL3Q6P499 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPAL3Q6P499 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPAL3Q6P499 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPAL3Q6P499 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPAL3Q6P499 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPAL3Q6P499 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPAL3Q6P499 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPAL3Q6P499 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPAL3Q6P499 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPAL3Q6P499 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIPAL3Q6P499 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIPAL3Q6P499 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIPAL3Q6P499 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPAL3Q6P499 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPAL3Q6P499 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPAL3Q6P499 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPAL3Q6P499 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPAL3Q6P499 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPAL3Q6P499 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPAL3Q6P499 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPAL3Q6P499 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPAL3Q6P499 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NIPAL3Q6P499 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NIPAL3Q6P499 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NIPAL3Q6P499 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms