Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC1

JMJD6, Bifunctional arginine demethylase and lysyl-hydroxylase JMJD6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD6Q6NYC1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
JMJD6Q6NYC1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
JMJD6Q6NYC1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
JMJD6Q6NYC1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
JMJD6Q6NYC1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
JMJD6Q6NYC1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
JMJD6Q6NYC1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
JMJD6Q6NYC1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
JMJD6Q6NYC1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
JMJD6Q6NYC1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
JMJD6Q6NYC1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
JMJD6Q6NYC1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
JMJD6Q6NYC1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
JMJD6Q6NYC1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
JMJD6Q6NYC1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
JMJD6Q6NYC1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
JMJD6Q6NYC1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
JMJD6Q6NYC1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
JMJD6Q6NYC1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
JMJD6Q6NYC1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
JMJD6Q6NYC1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
JMJD6Q6NYC1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
JMJD6Q6NYC1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
JMJD6Q6NYC1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
JMJD6Q6NYC1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
JMJD6Q6NYC1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
JMJD6Q6NYC1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
JMJD6Q6NYC1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
JMJD6Q6NYC1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
JMJD6Q6NYC1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
JMJD6Q6NYC1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
JMJD6Q6NYC1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
JMJD6Q6NYC1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
JMJD6Q6NYC1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
JMJD6Q6NYC1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
JMJD6Q6NYC1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
JMJD6Q6NYC1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
JMJD6Q6NYC1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
JMJD6Q6NYC1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
JMJD6Q6NYC1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
JMJD6Q6NYC1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
JMJD6Q6NYC1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
JMJD6Q6NYC1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
JMJD6Q6NYC1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
JMJD6Q6NYC1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
JMJD6Q6NYC1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
JMJD6Q6NYC1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
JMJD6Q6NYC1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
JMJD6Q6NYC1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
JMJD6Q6NYC1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
JMJD6Q6NYC1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
JMJD6Q6NYC1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
JMJD6Q6NYC1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
JMJD6Q6NYC1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
JMJD6Q6NYC1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
JMJD6Q6NYC1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
JMJD6Q6NYC1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
JMJD6Q6NYC1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
JMJD6Q6NYC1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
JMJD6Q6NYC1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
JMJD6Q6NYC1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
JMJD6Q6NYC1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
JMJD6Q6NYC1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
JMJD6Q6NYC1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
JMJD6Q6NYC1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
JMJD6Q6NYC1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
JMJD6Q6NYC1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
JMJD6Q6NYC1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
JMJD6Q6NYC1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
JMJD6Q6NYC1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
JMJD6Q6NYC1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
JMJD6Q6NYC1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
JMJD6Q6NYC1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
JMJD6Q6NYC1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
JMJD6Q6NYC1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
JMJD6Q6NYC1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
JMJD6Q6NYC1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
JMJD6Q6NYC1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
JMJD6Q6NYC1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
JMJD6Q6NYC1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
JMJD6Q6NYC1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
JMJD6Q6NYC1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
JMJD6Q6NYC1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
JMJD6Q6NYC1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
JMJD6Q6NYC1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
JMJD6Q6NYC1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
JMJD6Q6NYC1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
JMJD6Q6NYC1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
JMJD6Q6NYC1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
JMJD6Q6NYC1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
JMJD6Q6NYC1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
JMJD6Q6NYC1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
JMJD6Q6NYC1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
JMJD6Q6NYC1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
JMJD6Q6NYC1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
JMJD6Q6NYC1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
JMJD6Q6NYC1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
JMJD6Q6NYC1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
JMJD6Q6NYC1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
JMJD6Q6NYC1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms