Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP4R4Q6NUP7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP4R4Q6NUP7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP4R4Q6NUP7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP4R4Q6NUP7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP4R4Q6NUP7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP4R4Q6NUP7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP4R4Q6NUP7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP4R4Q6NUP7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP4R4Q6NUP7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP4R4Q6NUP7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP4R4Q6NUP7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP4R4Q6NUP7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP4R4Q6NUP7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP4R4Q6NUP7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP4R4Q6NUP7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP4R4Q6NUP7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP4R4Q6NUP7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP4R4Q6NUP7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP4R4Q6NUP7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP4R4Q6NUP7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP4R4Q6NUP7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP4R4Q6NUP7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP4R4Q6NUP7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP4R4Q6NUP7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP4R4Q6NUP7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PPP4R4Q6NUP7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPP4R4Q6NUP7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPP4R4Q6NUP7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP4R4Q6NUP7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP4R4Q6NUP7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP4R4Q6NUP7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP4R4Q6NUP7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP4R4Q6NUP7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP4R4Q6NUP7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP4R4Q6NUP7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP4R4Q6NUP7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP4R4Q6NUP7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP4R4Q6NUP7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP4R4Q6NUP7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP4R4Q6NUP7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP4R4Q6NUP7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP4R4Q6NUP7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP4R4Q6NUP7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP4R4Q6NUP7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP4R4Q6NUP7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP4R4Q6NUP7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP4R4Q6NUP7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP4R4Q6NUP7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP4R4Q6NUP7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPP4R4Q6NUP7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPP4R4Q6NUP7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PPP4R4Q6NUP7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP4R4Q6NUP7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP4R4Q6NUP7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP4R4Q6NUP7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP4R4Q6NUP7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP4R4Q6NUP7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP4R4Q6NUP7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP4R4Q6NUP7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP4R4Q6NUP7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP4R4Q6NUP7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.3 ms