Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LARP1BQ659C4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LARP1BQ659C4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LARP1BQ659C4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LARP1BQ659C4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LARP1BQ659C4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LARP1BQ659C4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LARP1BQ659C4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LARP1BQ659C4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LARP1BQ659C4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LARP1BQ659C4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LARP1BQ659C4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
LARP1BQ659C4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LARP1BQ659C4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LARP1BQ659C4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LARP1BQ659C4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LARP1BQ659C4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LARP1BQ659C4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LARP1BQ659C4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LARP1BQ659C4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
LARP1BQ659C4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LARP1BQ659C4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LARP1BQ659C4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LARP1BQ659C4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LARP1BQ659C4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LARP1BQ659C4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LARP1BQ659C4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LARP1BQ659C4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LARP1BQ659C4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LARP1BQ659C4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LARP1BQ659C4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LARP1BQ659C4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LARP1BQ659C4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LARP1BQ659C4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LARP1BQ659C4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LARP1BQ659C4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LARP1BQ659C4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LARP1BQ659C4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
LARP1BQ659C4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LARP1BQ659C4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LARP1BQ659C4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LARP1BQ659C4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LARP1BQ659C4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LARP1BQ659C4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
LARP1BQ659C4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
LARP1BQ659C4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LARP1BQ659C4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LARP1BQ659C4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LARP1BQ659C4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LARP1BQ659C4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LARP1BQ659C4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LARP1BQ659C4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LARP1BQ659C4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LARP1BQ659C4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LARP1BQ659C4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LARP1BQ659C4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LARP1BQ659C4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LARP1BQ659C4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LARP1BQ659C4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LARP1BQ659C4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LARP1BQ659C4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
LARP1BQ659C4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LARP1BQ659C4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
LARP1BQ659C4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LARP1BQ659C4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LARP1BQ659C4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LARP1BQ659C4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LARP1BQ659C4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LARP1BQ659C4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LARP1BQ659C4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
LARP1BQ659C4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LARP1BQ659C4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LARP1BQ659C4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LARP1BQ659C4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LARP1BQ659C4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LARP1BQ659C4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LARP1BQ659C4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LARP1BQ659C4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LARP1BQ659C4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LARP1BQ659C4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LARP1BQ659C4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LARP1BQ659C4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LARP1BQ659C4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LARP1BQ659C4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LARP1BQ659C4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LARP1BQ659C4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LARP1BQ659C4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LARP1BQ659C4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LARP1BQ659C4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LARP1BQ659C4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LARP1BQ659C4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LARP1BQ659C4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LARP1BQ659C4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LARP1BQ659C4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LARP1BQ659C4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LARP1BQ659C4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LARP1BQ659C4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LARP1BQ659C4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LARP1BQ659C4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LARP1BQ659C4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms