Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM208BQ5VWN6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM208BQ5VWN6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM208BQ5VWN6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM208BQ5VWN6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM208BQ5VWN6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM208BQ5VWN6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM208BQ5VWN6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM208BQ5VWN6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM208BQ5VWN6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM208BQ5VWN6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM208BQ5VWN6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM208BQ5VWN6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM208BQ5VWN6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM208BQ5VWN6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM208BQ5VWN6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM208BQ5VWN6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM208BQ5VWN6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM208BQ5VWN6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM208BQ5VWN6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM208BQ5VWN6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM208BQ5VWN6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM208BQ5VWN6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM208BQ5VWN6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM208BQ5VWN6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM208BQ5VWN6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM208BQ5VWN6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM208BQ5VWN6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM208BQ5VWN6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM208BQ5VWN6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM208BQ5VWN6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM208BQ5VWN6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM208BQ5VWN6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM208BQ5VWN6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM208BQ5VWN6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM208BQ5VWN6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM208BQ5VWN6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM208BQ5VWN6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM208BQ5VWN6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM208BQ5VWN6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM208BQ5VWN6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM208BQ5VWN6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM208BQ5VWN6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM208BQ5VWN6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FAM208BQ5VWN6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM208BQ5VWN6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM208BQ5VWN6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM208BQ5VWN6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM208BQ5VWN6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM208BQ5VWN6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM208BQ5VWN6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM208BQ5VWN6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM208BQ5VWN6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM208BQ5VWN6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM208BQ5VWN6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM208BQ5VWN6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM208BQ5VWN6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM208BQ5VWN6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM208BQ5VWN6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM208BQ5VWN6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM208BQ5VWN6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM208BQ5VWN6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM208BQ5VWN6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM208BQ5VWN6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM208BQ5VWN6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM208BQ5VWN6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM208BQ5VWN6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM208BQ5VWN6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM208BQ5VWN6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM208BQ5VWN6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM208BQ5VWN6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM208BQ5VWN6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM208BQ5VWN6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM208BQ5VWN6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM208BQ5VWN6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM208BQ5VWN6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM208BQ5VWN6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM208BQ5VWN6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM208BQ5VWN6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM208BQ5VWN6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM208BQ5VWN6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM208BQ5VWN6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM208BQ5VWN6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM208BQ5VWN6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM208BQ5VWN6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM208BQ5VWN6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM208BQ5VWN6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM208BQ5VWN6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM208BQ5VWN6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM208BQ5VWN6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM208BQ5VWN6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM208BQ5VWN6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM208BQ5VWN6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM208BQ5VWN6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM208BQ5VWN6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM208BQ5VWN6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM208BQ5VWN6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM208BQ5VWN6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM208BQ5VWN6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM208BQ5VWN6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
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