Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5M9

CCNJ, Cyclin-J, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNJQ5T5M9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNJQ5T5M9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNJQ5T5M9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNJQ5T5M9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNJQ5T5M9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNJQ5T5M9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNJQ5T5M9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNJQ5T5M9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNJQ5T5M9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNJQ5T5M9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNJQ5T5M9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNJQ5T5M9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNJQ5T5M9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNJQ5T5M9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNJQ5T5M9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCNJQ5T5M9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNJQ5T5M9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNJQ5T5M9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNJQ5T5M9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNJQ5T5M9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNJQ5T5M9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNJQ5T5M9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNJQ5T5M9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNJQ5T5M9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNJQ5T5M9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNJQ5T5M9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNJQ5T5M9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNJQ5T5M9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNJQ5T5M9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNJQ5T5M9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNJQ5T5M9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNJQ5T5M9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNJQ5T5M9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNJQ5T5M9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNJQ5T5M9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNJQ5T5M9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNJQ5T5M9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNJQ5T5M9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNJQ5T5M9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNJQ5T5M9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNJQ5T5M9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNJQ5T5M9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNJQ5T5M9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNJQ5T5M9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCNJQ5T5M9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNJQ5T5M9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNJQ5T5M9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNJQ5T5M9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNJQ5T5M9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNJQ5T5M9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNJQ5T5M9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNJQ5T5M9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNJQ5T5M9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNJQ5T5M9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNJQ5T5M9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNJQ5T5M9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNJQ5T5M9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNJQ5T5M9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNJQ5T5M9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNJQ5T5M9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNJQ5T5M9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNJQ5T5M9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNJQ5T5M9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNJQ5T5M9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNJQ5T5M9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNJQ5T5M9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNJQ5T5M9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNJQ5T5M9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNJQ5T5M9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNJQ5T5M9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNJQ5T5M9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNJQ5T5M9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNJQ5T5M9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNJQ5T5M9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNJQ5T5M9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNJQ5T5M9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNJQ5T5M9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCNJQ5T5M9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNJQ5T5M9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNJQ5T5M9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNJQ5T5M9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNJQ5T5M9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNJQ5T5M9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNJQ5T5M9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNJQ5T5M9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNJQ5T5M9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNJQ5T5M9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNJQ5T5M9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNJQ5T5M9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNJQ5T5M9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNJQ5T5M9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNJQ5T5M9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNJQ5T5M9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNJQ5T5M9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNJQ5T5M9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNJQ5T5M9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNJQ5T5M9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNJQ5T5M9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNJQ5T5M9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNJQ5T5M9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
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