Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUX0

SPIN3, Spindlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3Q5JUX0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPIN3Q5JUX0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPIN3Q5JUX0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPIN3Q5JUX0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SPIN3Q5JUX0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPIN3Q5JUX0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPIN3Q5JUX0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIN3Q5JUX0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIN3Q5JUX0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIN3Q5JUX0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIN3Q5JUX0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIN3Q5JUX0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIN3Q5JUX0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIN3Q5JUX0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIN3Q5JUX0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIN3Q5JUX0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPIN3Q5JUX0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPIN3Q5JUX0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPIN3Q5JUX0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPIN3Q5JUX0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPIN3Q5JUX0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPIN3Q5JUX0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPIN3Q5JUX0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPIN3Q5JUX0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIN3Q5JUX0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIN3Q5JUX0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIN3Q5JUX0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIN3Q5JUX0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIN3Q5JUX0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIN3Q5JUX0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIN3Q5JUX0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIN3Q5JUX0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPIN3Q5JUX0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPIN3Q5JUX0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPIN3Q5JUX0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPIN3Q5JUX0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPIN3Q5JUX0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPIN3Q5JUX0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPIN3Q5JUX0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPIN3Q5JUX0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPIN3Q5JUX0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPIN3Q5JUX0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPIN3Q5JUX0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPIN3Q5JUX0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPIN3Q5JUX0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIN3Q5JUX0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIN3Q5JUX0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIN3Q5JUX0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIN3Q5JUX0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIN3Q5JUX0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIN3Q5JUX0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIN3Q5JUX0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIN3Q5JUX0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIN3Q5JUX0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIN3Q5JUX0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIN3Q5JUX0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIN3Q5JUX0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIN3Q5JUX0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIN3Q5JUX0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIN3Q5JUX0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIN3Q5JUX0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIN3Q5JUX0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIN3Q5JUX0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIN3Q5JUX0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIN3Q5JUX0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPIN3Q5JUX0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIN3Q5JUX0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIN3Q5JUX0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIN3Q5JUX0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIN3Q5JUX0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIN3Q5JUX0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIN3Q5JUX0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIN3Q5JUX0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIN3Q5JUX0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms