Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RPL39P5Q59GN2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL39P5Q59GN2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL39P5Q59GN2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL39P5Q59GN2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL39P5Q59GN2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL39P5Q59GN2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL39P5Q59GN2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL39P5Q59GN2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL39P5Q59GN2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL39P5Q59GN2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL39P5Q59GN2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL39P5Q59GN2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL39P5Q59GN2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPL39P5Q59GN2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPL39P5Q59GN2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPL39P5Q59GN2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPL39P5Q59GN2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RPL39P5Q59GN2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPL39P5Q59GN2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPL39P5Q59GN2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPL39P5Q59GN2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPL39P5Q59GN2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPL39P5Q59GN2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL39P5Q59GN2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL39P5Q59GN2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL39P5Q59GN2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL39P5Q59GN2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
RPL39P5Q59GN2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL39P5Q59GN2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL39P5Q59GN2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL39P5Q59GN2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPL39P5Q59GN2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPL39P5Q59GN2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPL39P5Q59GN2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPL39P5Q59GN2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL39P5Q59GN2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL39P5Q59GN2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL39P5Q59GN2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL39P5Q59GN2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL39P5Q59GN2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL39P5Q59GN2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL39P5Q59GN2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL39P5Q59GN2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL39P5Q59GN2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL39P5Q59GN2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL39P5Q59GN2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPL39P5Q59GN2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPL39P5Q59GN2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPL39P5Q59GN2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL39P5Q59GN2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL39P5Q59GN2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL39P5Q59GN2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL39P5Q59GN2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL39P5Q59GN2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RPL39P5Q59GN2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RPL39P5Q59GN2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL39P5Q59GN2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPL39P5Q59GN2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL39P5Q59GN2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms