Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TPRNQ4KMQ1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TPRNQ4KMQ1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TPRNQ4KMQ1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TPRNQ4KMQ1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TPRNQ4KMQ1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TPRNQ4KMQ1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TPRNQ4KMQ1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TPRNQ4KMQ1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TPRNQ4KMQ1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TPRNQ4KMQ1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TPRNQ4KMQ1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TPRNQ4KMQ1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TPRNQ4KMQ1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TPRNQ4KMQ1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TPRNQ4KMQ1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TPRNQ4KMQ1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TPRNQ4KMQ1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TPRNQ4KMQ1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TPRNQ4KMQ1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TPRNQ4KMQ1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TPRNQ4KMQ1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TPRNQ4KMQ1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TPRNQ4KMQ1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TPRNQ4KMQ1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TPRNQ4KMQ1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TPRNQ4KMQ1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TPRNQ4KMQ1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TPRNQ4KMQ1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TPRNQ4KMQ1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TPRNQ4KMQ1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TPRNQ4KMQ1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TPRNQ4KMQ1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TPRNQ4KMQ1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TPRNQ4KMQ1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TPRNQ4KMQ1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TPRNQ4KMQ1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TPRNQ4KMQ1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TPRNQ4KMQ1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TPRNQ4KMQ1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TPRNQ4KMQ1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TPRNQ4KMQ1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TPRNQ4KMQ1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TPRNQ4KMQ1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TPRNQ4KMQ1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TPRNQ4KMQ1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TPRNQ4KMQ1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TPRNQ4KMQ1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TPRNQ4KMQ1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TPRNQ4KMQ1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TPRNQ4KMQ1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TPRNQ4KMQ1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TPRNQ4KMQ1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TPRNQ4KMQ1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TPRNQ4KMQ1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TPRNQ4KMQ1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TPRNQ4KMQ1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TPRNQ4KMQ1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TPRNQ4KMQ1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TPRNQ4KMQ1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TPRNQ4KMQ1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TPRNQ4KMQ1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TPRNQ4KMQ1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TPRNQ4KMQ1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TPRNQ4KMQ1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TPRNQ4KMQ1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TPRNQ4KMQ1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TPRNQ4KMQ1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TPRNQ4KMQ1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TPRNQ4KMQ1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TPRNQ4KMQ1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TPRNQ4KMQ1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TPRNQ4KMQ1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TPRNQ4KMQ1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TPRNQ4KMQ1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TPRNQ4KMQ1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TPRNQ4KMQ1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TPRNQ4KMQ1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TPRNQ4KMQ1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TPRNQ4KMQ1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TPRNQ4KMQ1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TPRNQ4KMQ1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TPRNQ4KMQ1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TPRNQ4KMQ1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TPRNQ4KMQ1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TPRNQ4KMQ1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TPRNQ4KMQ1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TPRNQ4KMQ1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TPRNQ4KMQ1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TPRNQ4KMQ1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TPRNQ4KMQ1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TPRNQ4KMQ1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TPRNQ4KMQ1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TPRNQ4KMQ1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TPRNQ4KMQ1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TPRNQ4KMQ1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TPRNQ4KMQ1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TPRNQ4KMQ1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TPRNQ4KMQ1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TPRNQ4KMQ1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
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