Protein–RNA interactions for Protein: Q15424

SAFB, Scaffold attachment factor B1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAFBQ15424 ANKRD11-204ENST00000378332 1982 ntTSL 224.43■■□□□ 1.56e-7■■□□□ 12.3
SAFBQ15424 ANKRD11-210ENST00000566858 580 ntTSL 417.67■□□□□ 0.426e-7■■□□□ 12.3
SAFBQ15424 ANKRD11-213ENST00000567736 2750 ntTSL 217.37■□□□□ 0.376e-7■■□□□ 12.3
SAFBQ15424 ANKRD11-202ENST00000330736 8342 ntTSL 516.46■□□□□ 0.236e-7■■□□□ 12.3
SAFBQ15424 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.26e-7■■□□□ 12.3
SAFBQ15424 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.176e-7■■□□□ 12.3
SAFBQ15424 ANKRD11-206ENST00000562275 2762 ntTSL 516■□□□□ 0.156e-7■■□□□ 12.3
SAFBQ15424 ANKRD11-216ENST00000568924 587 ntTSL 415.92■□□□□ 0.146e-7■■□□□ 12.3
SAFBQ15424 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.136e-7■■□□□ 12.3
SAFBQ15424 ANKRD11-209ENST00000564553 471 ntTSL 315.7■□□□□ 0.16e-7■■□□□ 12.3
SAFBQ15424 ANKRD11-207ENST00000562816 573 ntTSL 412.46□□□□□ -0.416e-7■■□□□ 12.3
SAFBQ15424 EVA1A-211ENST00000490746 589 ntTSL 519.74■□□□□ 0.757e-7■■□□□ 12.3
SAFBQ15424 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.747e-7■■□□□ 12.3
SAFBQ15424 EVA1A-208ENST00000485891 479 ntTSL 518.35■□□□□ 0.537e-7■■□□□ 12.3
SAFBQ15424 EVA1A-206ENST00000432649 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 318.05■□□□□ 0.487e-7■■□□□ 12.3
SAFBQ15424 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.247e-7■■□□□ 12.3
SAFBQ15424 EVA1A-201ENST00000233712 1815 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 07e-7■■□□□ 12.3
SAFBQ15424 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.097e-7■■□□□ 12.3
SAFBQ15424 EVA1A-210ENST00000486696 585 ntTSL 38.06□□□□□ -1.127e-7■■□□□ 12.3
SAFBQ15424 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.674e-7■■□□□ 12.3
SAFBQ15424 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.414e-7■■□□□ 12.3
SAFBQ15424 ETFB-205ENST00000596253 575 ntTSL 316.95■□□□□ 0.34e-7■■□□□ 12.3
SAFBQ15424 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.184e-7■■□□□ 12.3
SAFBQ15424 ETFB-204ENST00000594361 2843 nt14.13□□□□□ -0.154e-7■■□□□ 12.3
SAFBQ15424 CCT6P3-202ENST00000426828 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.344e-7■■□□□ 12.3
SAFBQ15424 ETFB-202ENST00000354232 3551 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.544e-7■■□□□ 12.3
SAFBQ15424 SH3D19-212ENST00000604440 555 ntTSL 49.92□□□□□ -0.824e-7■■□□□ 12.3
SAFBQ15424 TMEM242-202ENST00000400788 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.63e-7■■□□□ 12.2
SAFBQ15424 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.375e-7■■□□□ 12.1
SAFBQ15424 CDCA2-202ENST00000380665 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.015e-7■■□□□ 12.1
SAFBQ15424 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.345e-7■■□□□ 12.1
SAFBQ15424 CDCA2-204ENST00000521098 2409 ntTSL 56.13□□□□□ -1.435e-7■■□□□ 12.1
SAFBQ15424 LINC01033-203ENST00000517934 306 ntTSL 21.97□□□□□ -2.095e-7■■□□□ 12.1
SAFBQ15424 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.195e-7■■□□□ 12
SAFBQ15424 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.035e-7■■□□□ 12
SAFBQ15424 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.915e-7■■□□□ 12
SAFBQ15424 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.755e-7■■□□□ 12
SAFBQ15424 CHTOP-206ENST00000495554 2553 ntTSL 217.07■□□□□ 0.325e-7■■□□□ 12
SAFBQ15424 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.645e-7■■□□□ 12
SAFBQ15424 GREB1-207ENST00000432985 2052 ntTSL 1 (best)14.49□□□□□ -0.097e-7■■□□□ 12
SAFBQ15424 GREB1-201ENST00000234142 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.117e-7■■□□□ 12
SAFBQ15424 GREB1-204ENST00000381486 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.127e-7■■□□□ 12
SAFBQ15424 ZC3H11A-206ENST00000453771 1892 ntTSL 513.23□□□□□ -0.294e-7■■□□□ 12
SAFBQ15424 ZC3H11A-205ENST00000432282 682 ntTSL 510.55□□□□□ -0.724e-7■■□□□ 12
SAFBQ15424 ZC3H11A-208ENST00000466470 944 ntTSL 210.55□□□□□ -0.724e-7■■□□□ 12
SAFBQ15424 ZC3H11A-207ENST00000461980 822 ntTSL 29.2□□□□□ -0.944e-7■■□□□ 12
SAFBQ15424 ZC3H11A-203ENST00000367212 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.944e-7■■□□□ 12
SAFBQ15424 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.094e-7■■□□□ 12
SAFBQ15424 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.174e-7■■□□□ 12
SAFBQ15424 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.194e-7■■□□□ 12
SAFBQ15424 ZC3H11A-213ENST00000638800 7078 ntTSL 56.54□□□□□ -1.364e-7■■□□□ 12
SAFBQ15424 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.414e-7■■□□□ 12
SAFBQ15424 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.624e-7■■□□□ 12
SAFBQ15424 MALAT1-204ENST00000610481 353 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.446e-46■■□□□ 12
SAFBQ15424 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.413e-6■■□□□ 12
SAFBQ15424 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.433e-6■■□□□ 12
SAFBQ15424 AP000547.3-203ENST00000591299 751 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.263e-6■■□□□ 12
SAFBQ15424 ANKRD12-204ENST00000540578 1338 ntTSL 1 (best)15.47■□□□□ 0.075e-6■■□□□ 11.9
SAFBQ15424 GPC3-203ENST00000406757 836 ntTSL 29.56□□□□□ -0.882e-12■■□□□ 11.9
SAFBQ15424 TPTEP1-207ENST00000588424 1602 ntTSL 58.19□□□□□ -1.18e-7■■□□□ 11.9
SAFBQ15424 AC079466.1-201ENST00000587961 4453 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.662e-10■■□□□ 11.8
SAFBQ15424 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.382e-6■■□□□ 11.8
SAFBQ15424 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.142e-6■■□□□ 11.8
SAFBQ15424 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.892e-6■■□□□ 11.8
SAFBQ15424 SCARB1-205ENST00000538291 5527 ntTSL 520.43■□□□□ 0.862e-6■■□□□ 11.8
SAFBQ15424 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.552e-6■■□□□ 11.8
SAFBQ15424 SCARB1-209ENST00000545305 851 ntTSL 215.92■□□□□ 0.142e-6■■□□□ 11.8
SAFBQ15424 SCARB1-204ENST00000535005 1845 ntTSL 1 (best)14.06□□□□□ -0.162e-6■■□□□ 11.8
SAFBQ15424 PLCXD1-211ENST00000484611 540 ntTSL 417.22■□□□□ 0.352e-6■■□□□ 11.8
SAFBQ15424 PLCXD1-206ENST00000430923 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.94■□□□□ 0.32e-6■■□□□ 11.8
SAFBQ15424 PLCXD1-203ENST00000399012 5287 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.092e-6■■□□□ 11.8
SAFBQ15424 N4BP2L2-212ENST00000505213 2343 ntTSL 511.84□□□□□ -0.511e-6■■□□□ 11.8
SAFBQ15424 N4BP2L2-214ENST00000511143 816 ntTSL 38.6□□□□□ -1.031e-6■■□□□ 11.8
SAFBQ15424 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.411e-6■■□□□ 11.8
SAFBQ15424 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.61e-6■■□□□ 11.8
SAFBQ15424 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.651e-6■■□□□ 11.8
SAFBQ15424 N4BP2L2-215ENST00000512755 1273 ntTSL 24.59□□□□□ -1.671e-6■■□□□ 11.8
SAFBQ15424 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.881e-6■■□□□ 11.8
SAFBQ15424 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.951e-6■■□□□ 11.8
SAFBQ15424 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.292e-7■■□□□ 11.7
SAFBQ15424 SRSF4-206ENST00000605204 1399 ntTSL 1 (best)21.73■■□□□ 1.072e-7■■□□□ 11.7
SAFBQ15424 SRSF4-202ENST00000466448 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 320.73■□□□□ 0.912e-7■■□□□ 11.7
SAFBQ15424 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.193e-7■■□□□ 11.7
SAFBQ15424 MALAT1-202ENST00000534336 8708 ntBASIC11.13□□□□□ -0.632e-35■■□□□ 11.6
SAFBQ15424 MALAT1-203ENST00000544868 480 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.092e-35■■□□□ 11.6
SAFBQ15424 CEP192-204ENST00000507064 706 ntTSL 313.18□□□□□ -0.31e-6■■□□□ 11.6
SAFBQ15424 IGFL2-AS1-201ENST00000594027 294 ntTSL 312.63□□□□□ -0.392e-9■■□□□ 11.6
SAFBQ15424 IGFL2-AS1-204ENST00000598754 470 ntTSL 212.63□□□□□ -0.392e-9■■□□□ 11.6
SAFBQ15424 IGFL2-AS1-205ENST00000599817 340 ntTSL 212.23□□□□□ -0.452e-9■■□□□ 11.6
SAFBQ15424 IGFL2-AS1-203ENST00000598518 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.572e-9■■□□□ 11.6
SAFBQ15424 PSMA3-AS1-204ENST00000554360 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.641e-8■■□□□ 11.6
SAFBQ15424 C14orf37-203ENST00000554218 572 ntTSL 49.18□□□□□ -0.941e-8■■□□□ 11.6
SAFBQ15424 CEP192-214ENST00000589596 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 27.54□□□□□ -1.21e-6■■□□□ 11.6
SAFBQ15424 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.292e-9■■□□□ 11.6
SAFBQ15424 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.511e-6■■□□□ 11.6
SAFBQ15424 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.561e-6■■□□□ 11.6
SAFBQ15424 DSCR4-203ENST00000482032 799 ntTSL 34.23□□□□□ -1.732e-6■■□□□ 11.5
SAFBQ15424 NKD1-202ENST00000564336 477 ntTSL 325.19■■□□□ 1.622e-6■■□□□ 11.5
SAFBQ15424 G6PC-202ENST00000585489 1097 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.492e-8■■□□□ 11.5
SAFBQ15424 NKD1-201ENST00000268459 17105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.582e-6■■□□□ 11.5
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