RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554360.5

PSMA3-AS1-204, PSMA3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PSMA3-AS1, Length 2,475 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 NISCHQ9Y2I1 1504 aa22.07■■□□□ 1.12
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PSMA3-AS1-204ENST00000554360 MYO15BQ96JP2 1530 aa18.15■□□□□ 0.5
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PSMA3-AS1-204ENST00000554360 PEG3Q9GZU2 1588 aa16.84■□□□□ 0.29
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PSMA3-AS1-204ENST00000554360 MYT1Q01538 1121 aa16.74■□□□□ 0.27
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PSMA3-AS1-204ENST00000554360 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.52■□□□□ 0.24
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PSMA3-AS1-204ENST00000554360 PRDM2Q13029 1718 aa16.26■□□□□ 0.19
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 CHIC1Q5VXU3 224 aa16.24■□□□□ 0.19
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 CFTRP13569 1480 aa16.23■□□□□ 0.19
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 CADPSQ9ULU8 1353 aa16.19■□□□□ 0.18
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.16■□□□□ 0.18
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PSMA3-AS1-204ENST00000554360 ABCC8Q09428 1581 aa16.11■□□□□ 0.17
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PSMA3-AS1-204ENST00000554360 TRIM41Q8WV44 630 aa16.08■□□□□ 0.17
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 NESP48681 1621 aa16.07■□□□□ 0.16
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PSMA3-AS1-204ENST00000554360 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa15.57■□□□□ 0.08
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PSMA3-AS1-204ENST00000554360 PBRM1Q86U86 1689 aa15.51■□□□□ 0.07
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PSMA3-AS1-204ENST00000554360 PRXQ9BXM0 1461 aa15.51■□□□□ 0.07
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
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PSMA3-AS1-204ENST00000554360 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.46■□□□□ 0.06
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.44■□□□□ 0.06
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.44■□□□□ 0.061e-8■■■□□ 16.1
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 GRIN2BQ13224 1484 aa15.43■□□□□ 0.06
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 PLPPR3Q6T4P5 718 aa15.43■□□□□ 0.06
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 TNIKQ9UKE5 1360 aa15.42■□□□□ 0.06
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