Protein–RNA interactions for Protein: Q14114

LRP8, Low-density lipoprotein receptor-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP8Q14114 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRP8Q14114 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRP8Q14114 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRP8Q14114 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRP8Q14114 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRP8Q14114 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRP8Q14114 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LRP8Q14114 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LRP8Q14114 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRP8Q14114 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRP8Q14114 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRP8Q14114 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRP8Q14114 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRP8Q14114 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRP8Q14114 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRP8Q14114 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRP8Q14114 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRP8Q14114 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRP8Q14114 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRP8Q14114 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRP8Q14114 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRP8Q14114 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LRP8Q14114 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRP8Q14114 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRP8Q14114 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRP8Q14114 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRP8Q14114 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRP8Q14114 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRP8Q14114 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRP8Q14114 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP8Q14114 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LRP8Q14114 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRP8Q14114 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRP8Q14114 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRP8Q14114 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP8Q14114 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP8Q14114 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP8Q14114 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP8Q14114 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP8Q14114 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP8Q14114 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP8Q14114 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRP8Q14114 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRP8Q14114 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRP8Q14114 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRP8Q14114 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LRP8Q14114 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRP8Q14114 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LRP8Q14114 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRP8Q14114 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRP8Q14114 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRP8Q14114 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRP8Q14114 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRP8Q14114 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRP8Q14114 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LRP8Q14114 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRP8Q14114 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRP8Q14114 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRP8Q14114 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRP8Q14114 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRP8Q14114 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRP8Q14114 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRP8Q14114 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRP8Q14114 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRP8Q14114 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRP8Q14114 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRP8Q14114 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRP8Q14114 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRP8Q14114 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRP8Q14114 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRP8Q14114 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRP8Q14114 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRP8Q14114 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRP8Q14114 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRP8Q14114 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRP8Q14114 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRP8Q14114 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRP8Q14114 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LRP8Q14114 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRP8Q14114 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRP8Q14114 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRP8Q14114 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRP8Q14114 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRP8Q14114 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRP8Q14114 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LRP8Q14114 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRP8Q14114 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRP8Q14114 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRP8Q14114 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRP8Q14114 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRP8Q14114 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRP8Q14114 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRP8Q14114 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRP8Q14114 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRP8Q14114 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LRP8Q14114 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRP8Q14114 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRP8Q14114 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRP8Q14114 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRP8Q14114 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms