Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CIRBPQ14011 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CIRBPQ14011 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CIRBPQ14011 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIRBPQ14011 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIRBPQ14011 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIRBPQ14011 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CIRBPQ14011 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIRBPQ14011 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIRBPQ14011 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIRBPQ14011 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CIRBPQ14011 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CIRBPQ14011 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CIRBPQ14011 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CIRBPQ14011 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CIRBPQ14011 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CIRBPQ14011 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CIRBPQ14011 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CIRBPQ14011 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CIRBPQ14011 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CIRBPQ14011 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CIRBPQ14011 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CIRBPQ14011 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CIRBPQ14011 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIRBPQ14011 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIRBPQ14011 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIRBPQ14011 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CIRBPQ14011 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CIRBPQ14011 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CIRBPQ14011 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CIRBPQ14011 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CIRBPQ14011 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CIRBPQ14011 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CIRBPQ14011 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CIRBPQ14011 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CIRBPQ14011 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CIRBPQ14011 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CIRBPQ14011 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CIRBPQ14011 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CIRBPQ14011 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CIRBPQ14011 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CIRBPQ14011 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CIRBPQ14011 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CIRBPQ14011 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CIRBPQ14011 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CIRBPQ14011 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CIRBPQ14011 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CIRBPQ14011 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CIRBPQ14011 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CIRBPQ14011 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CIRBPQ14011 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CIRBPQ14011 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CIRBPQ14011 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CIRBPQ14011 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CIRBPQ14011 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CIRBPQ14011 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CIRBPQ14011 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CIRBPQ14011 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIRBPQ14011 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIRBPQ14011 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIRBPQ14011 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIRBPQ14011 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIRBPQ14011 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIRBPQ14011 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIRBPQ14011 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIRBPQ14011 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIRBPQ14011 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIRBPQ14011 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CIRBPQ14011 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIRBPQ14011 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIRBPQ14011 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIRBPQ14011 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIRBPQ14011 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIRBPQ14011 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIRBPQ14011 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIRBPQ14011 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIRBPQ14011 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIRBPQ14011 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CIRBPQ14011 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CIRBPQ14011 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CIRBPQ14011 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CIRBPQ14011 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CIRBPQ14011 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CIRBPQ14011 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CIRBPQ14011 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CIRBPQ14011 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CIRBPQ14011 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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